Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWE0

LRSAM1, E3 ubiquitin-protein ligase LRSAM1, humanhuman

Predictions only

Length 723 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRSAM1Q6UWE0 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LRSAM1Q6UWE0 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
LRSAM1Q6UWE0 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LRSAM1Q6UWE0 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LRSAM1Q6UWE0 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LRSAM1Q6UWE0 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LRSAM1Q6UWE0 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LRSAM1Q6UWE0 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LRSAM1Q6UWE0 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LRSAM1Q6UWE0 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LRSAM1Q6UWE0 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LRSAM1Q6UWE0 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LRSAM1Q6UWE0 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LRSAM1Q6UWE0 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LRSAM1Q6UWE0 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LRSAM1Q6UWE0 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LRSAM1Q6UWE0 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LRSAM1Q6UWE0 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LRSAM1Q6UWE0 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LRSAM1Q6UWE0 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LRSAM1Q6UWE0 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LRSAM1Q6UWE0 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LRSAM1Q6UWE0 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LRSAM1Q6UWE0 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LRSAM1Q6UWE0 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LRSAM1Q6UWE0 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LRSAM1Q6UWE0 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LRSAM1Q6UWE0 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LRSAM1Q6UWE0 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LRSAM1Q6UWE0 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LRSAM1Q6UWE0 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LRSAM1Q6UWE0 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LRSAM1Q6UWE0 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LRSAM1Q6UWE0 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LRSAM1Q6UWE0 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LRSAM1Q6UWE0 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LRSAM1Q6UWE0 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LRSAM1Q6UWE0 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LRSAM1Q6UWE0 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRSAM1Q6UWE0 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRSAM1Q6UWE0 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRSAM1Q6UWE0 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRSAM1Q6UWE0 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRSAM1Q6UWE0 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRSAM1Q6UWE0 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRSAM1Q6UWE0 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRSAM1Q6UWE0 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRSAM1Q6UWE0 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRSAM1Q6UWE0 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRSAM1Q6UWE0 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRSAM1Q6UWE0 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRSAM1Q6UWE0 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRSAM1Q6UWE0 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRSAM1Q6UWE0 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRSAM1Q6UWE0 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRSAM1Q6UWE0 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LRSAM1Q6UWE0 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LRSAM1Q6UWE0 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LRSAM1Q6UWE0 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LRSAM1Q6UWE0 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LRSAM1Q6UWE0 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LRSAM1Q6UWE0 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LRSAM1Q6UWE0 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LRSAM1Q6UWE0 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LRSAM1Q6UWE0 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
LRSAM1Q6UWE0 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
LRSAM1Q6UWE0 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
LRSAM1Q6UWE0 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
LRSAM1Q6UWE0 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
LRSAM1Q6UWE0 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRSAM1Q6UWE0 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRSAM1Q6UWE0 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRSAM1Q6UWE0 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRSAM1Q6UWE0 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRSAM1Q6UWE0 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRSAM1Q6UWE0 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRSAM1Q6UWE0 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRSAM1Q6UWE0 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRSAM1Q6UWE0 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
LRSAM1Q6UWE0 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRSAM1Q6UWE0 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRSAM1Q6UWE0 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRSAM1Q6UWE0 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRSAM1Q6UWE0 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
LRSAM1Q6UWE0 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRSAM1Q6UWE0 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRSAM1Q6UWE0 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRSAM1Q6UWE0 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRSAM1Q6UWE0 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRSAM1Q6UWE0 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRSAM1Q6UWE0 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRSAM1Q6UWE0 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRSAM1Q6UWE0 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRSAM1Q6UWE0 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRSAM1Q6UWE0 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRSAM1Q6UWE0 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRSAM1Q6UWE0 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRSAM1Q6UWE0 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRSAM1Q6UWE0 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRSAM1Q6UWE0 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms