Protein–RNA interactions for Protein: Q6R6M4

USP17L2, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L2Q6R6M4 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
USP17L2Q6R6M4 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
USP17L2Q6R6M4 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
USP17L2Q6R6M4 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
USP17L2Q6R6M4 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
USP17L2Q6R6M4 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
USP17L2Q6R6M4 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
USP17L2Q6R6M4 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
USP17L2Q6R6M4 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
USP17L2Q6R6M4 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
USP17L2Q6R6M4 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
USP17L2Q6R6M4 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
USP17L2Q6R6M4 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
USP17L2Q6R6M4 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
USP17L2Q6R6M4 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
USP17L2Q6R6M4 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
USP17L2Q6R6M4 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
USP17L2Q6R6M4 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
USP17L2Q6R6M4 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
USP17L2Q6R6M4 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
USP17L2Q6R6M4 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
USP17L2Q6R6M4 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
USP17L2Q6R6M4 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
USP17L2Q6R6M4 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
USP17L2Q6R6M4 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
USP17L2Q6R6M4 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
USP17L2Q6R6M4 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
USP17L2Q6R6M4 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
USP17L2Q6R6M4 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
USP17L2Q6R6M4 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
USP17L2Q6R6M4 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
USP17L2Q6R6M4 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
USP17L2Q6R6M4 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
USP17L2Q6R6M4 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
USP17L2Q6R6M4 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
USP17L2Q6R6M4 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
USP17L2Q6R6M4 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
USP17L2Q6R6M4 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
USP17L2Q6R6M4 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
USP17L2Q6R6M4 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
USP17L2Q6R6M4 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
USP17L2Q6R6M4 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
USP17L2Q6R6M4 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
USP17L2Q6R6M4 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
USP17L2Q6R6M4 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
USP17L2Q6R6M4 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
USP17L2Q6R6M4 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
USP17L2Q6R6M4 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
USP17L2Q6R6M4 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
USP17L2Q6R6M4 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
USP17L2Q6R6M4 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
USP17L2Q6R6M4 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
USP17L2Q6R6M4 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
USP17L2Q6R6M4 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
USP17L2Q6R6M4 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
USP17L2Q6R6M4 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
USP17L2Q6R6M4 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
USP17L2Q6R6M4 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
USP17L2Q6R6M4 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
USP17L2Q6R6M4 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
USP17L2Q6R6M4 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
USP17L2Q6R6M4 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
USP17L2Q6R6M4 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
USP17L2Q6R6M4 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
USP17L2Q6R6M4 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
USP17L2Q6R6M4 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
USP17L2Q6R6M4 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
USP17L2Q6R6M4 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
USP17L2Q6R6M4 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
USP17L2Q6R6M4 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
USP17L2Q6R6M4 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
USP17L2Q6R6M4 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
USP17L2Q6R6M4 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
USP17L2Q6R6M4 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
USP17L2Q6R6M4 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
USP17L2Q6R6M4 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
USP17L2Q6R6M4 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
USP17L2Q6R6M4 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
USP17L2Q6R6M4 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
USP17L2Q6R6M4 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
USP17L2Q6R6M4 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
USP17L2Q6R6M4 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
USP17L2Q6R6M4 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
USP17L2Q6R6M4 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
USP17L2Q6R6M4 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
USP17L2Q6R6M4 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
USP17L2Q6R6M4 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
USP17L2Q6R6M4 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
USP17L2Q6R6M4 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
USP17L2Q6R6M4 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
USP17L2Q6R6M4 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
USP17L2Q6R6M4 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
USP17L2Q6R6M4 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
USP17L2Q6R6M4 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
USP17L2Q6R6M4 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
USP17L2Q6R6M4 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
USP17L2Q6R6M4 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
USP17L2Q6R6M4 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
USP17L2Q6R6M4 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
USP17L2Q6R6M4 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.6 ms