Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEY2

TUBA3E, Tubulin alpha-3E chain, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA3EQ6PEY2 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TUBA3EQ6PEY2 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TUBA3EQ6PEY2 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
TUBA3EQ6PEY2 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
TUBA3EQ6PEY2 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TUBA3EQ6PEY2 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
TUBA3EQ6PEY2 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
TUBA3EQ6PEY2 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TUBA3EQ6PEY2 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
TUBA3EQ6PEY2 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
TUBA3EQ6PEY2 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
TUBA3EQ6PEY2 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TUBA3EQ6PEY2 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TUBA3EQ6PEY2 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TUBA3EQ6PEY2 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TUBA3EQ6PEY2 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TUBA3EQ6PEY2 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
TUBA3EQ6PEY2 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TUBA3EQ6PEY2 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TUBA3EQ6PEY2 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TUBA3EQ6PEY2 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
TUBA3EQ6PEY2 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
TUBA3EQ6PEY2 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
TUBA3EQ6PEY2 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
TUBA3EQ6PEY2 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TUBA3EQ6PEY2 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TUBA3EQ6PEY2 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TUBA3EQ6PEY2 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TUBA3EQ6PEY2 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
TUBA3EQ6PEY2 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TUBA3EQ6PEY2 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
TUBA3EQ6PEY2 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TUBA3EQ6PEY2 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TUBA3EQ6PEY2 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TUBA3EQ6PEY2 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TUBA3EQ6PEY2 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TUBA3EQ6PEY2 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TUBA3EQ6PEY2 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TUBA3EQ6PEY2 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TUBA3EQ6PEY2 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TUBA3EQ6PEY2 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TUBA3EQ6PEY2 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TUBA3EQ6PEY2 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TUBA3EQ6PEY2 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
TUBA3EQ6PEY2 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TUBA3EQ6PEY2 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TUBA3EQ6PEY2 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TUBA3EQ6PEY2 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TUBA3EQ6PEY2 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TUBA3EQ6PEY2 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TUBA3EQ6PEY2 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TUBA3EQ6PEY2 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TUBA3EQ6PEY2 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TUBA3EQ6PEY2 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TUBA3EQ6PEY2 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TUBA3EQ6PEY2 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TUBA3EQ6PEY2 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TUBA3EQ6PEY2 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TUBA3EQ6PEY2 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TUBA3EQ6PEY2 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TUBA3EQ6PEY2 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
TUBA3EQ6PEY2 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TUBA3EQ6PEY2 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TUBA3EQ6PEY2 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TUBA3EQ6PEY2 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TUBA3EQ6PEY2 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TUBA3EQ6PEY2 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TUBA3EQ6PEY2 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TUBA3EQ6PEY2 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TUBA3EQ6PEY2 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TUBA3EQ6PEY2 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TUBA3EQ6PEY2 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TUBA3EQ6PEY2 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TUBA3EQ6PEY2 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TUBA3EQ6PEY2 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TUBA3EQ6PEY2 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TUBA3EQ6PEY2 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TUBA3EQ6PEY2 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TUBA3EQ6PEY2 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TUBA3EQ6PEY2 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TUBA3EQ6PEY2 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TUBA3EQ6PEY2 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TUBA3EQ6PEY2 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TUBA3EQ6PEY2 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TUBA3EQ6PEY2 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TUBA3EQ6PEY2 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TUBA3EQ6PEY2 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TUBA3EQ6PEY2 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TUBA3EQ6PEY2 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TUBA3EQ6PEY2 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TUBA3EQ6PEY2 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TUBA3EQ6PEY2 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TUBA3EQ6PEY2 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TUBA3EQ6PEY2 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TUBA3EQ6PEY2 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TUBA3EQ6PEY2 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TUBA3EQ6PEY2 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TUBA3EQ6PEY2 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TUBA3EQ6PEY2 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TUBA3EQ6PEY2 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms