Protein–RNA interactions for Protein: Q6KC79

NIPBL, Nipped-B-like protein, humanhuman

eCLIP

Length 2,804 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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NIPBLQ6KC79 SMG1-211ENST00000565324 12465 ntTSL 1 (best)2.87□□□□□ -1.957e-6■□□□□ 10.5
NIPBLQ6KC79 FBXL13-207ENST00000455112 2274 ntTSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.017e-6■□□□□ 10.5
NIPBLQ6KC79 FBXL13-204ENST00000436908 2577 ntTSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.037e-6■□□□□ 10.5
NIPBLQ6KC79 FBXL13-208ENST00000456695 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.03□□□□□ -2.087e-6■□□□□ 10.5
NIPBLQ6KC79 SENP6-207ENST00000476060 2254 ntTSL 21.08□□□□□ -2.247e-6■□□□□ 10.5
NIPBLQ6KC79 CEP290-203ENST00000547691 5968 ntTSL 1 (best) BASIC0.77□□□□□ -2.297e-6■□□□□ 10.5
NIPBLQ6KC79 SENP6-212ENST00000503501 2041 ntTSL 2-0.08□□□□□ -2.427e-6■□□□□ 10.5
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NIPBLQ6KC79 PRKAB1-208ENST00000545223 583 ntTSL 26.36□□□□□ -1.398e-8■□□□□ 10.4
NIPBLQ6KC79 PRKAB1-209ENST00000545870 566 ntTSL 35.81□□□□□ -1.488e-8■□□□□ 10.4
NIPBLQ6KC79 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.075e-26■□□□□ 10.4
NIPBLQ6KC79 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.465e-26■□□□□ 10.4
NIPBLQ6KC79 HSP90B1-203ENST00000548462 3032 ntTSL 29.11□□□□□ -0.955e-26■□□□□ 10.4
NIPBLQ6KC79 SNORA26-201ENST00000391286 122 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.484e-48■□□□□ 10.4
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