Protein–RNA interactions for Protein: Q6IPU0

CENPP, Centromere protein P, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPPQ6IPU0 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CENPPQ6IPU0 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CENPPQ6IPU0 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CENPPQ6IPU0 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CENPPQ6IPU0 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CENPPQ6IPU0 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CENPPQ6IPU0 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CENPPQ6IPU0 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CENPPQ6IPU0 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CENPPQ6IPU0 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CENPPQ6IPU0 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CENPPQ6IPU0 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CENPPQ6IPU0 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CENPPQ6IPU0 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CENPPQ6IPU0 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CENPPQ6IPU0 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CENPPQ6IPU0 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CENPPQ6IPU0 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CENPPQ6IPU0 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CENPPQ6IPU0 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CENPPQ6IPU0 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CENPPQ6IPU0 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CENPPQ6IPU0 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CENPPQ6IPU0 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CENPPQ6IPU0 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CENPPQ6IPU0 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CENPPQ6IPU0 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CENPPQ6IPU0 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CENPPQ6IPU0 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CENPPQ6IPU0 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CENPPQ6IPU0 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CENPPQ6IPU0 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CENPPQ6IPU0 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CENPPQ6IPU0 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CENPPQ6IPU0 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CENPPQ6IPU0 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CENPPQ6IPU0 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CENPPQ6IPU0 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CENPPQ6IPU0 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CENPPQ6IPU0 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CENPPQ6IPU0 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CENPPQ6IPU0 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CENPPQ6IPU0 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CENPPQ6IPU0 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CENPPQ6IPU0 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CENPPQ6IPU0 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CENPPQ6IPU0 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CENPPQ6IPU0 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CENPPQ6IPU0 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CENPPQ6IPU0 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CENPPQ6IPU0 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CENPPQ6IPU0 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CENPPQ6IPU0 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CENPPQ6IPU0 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CENPPQ6IPU0 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CENPPQ6IPU0 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CENPPQ6IPU0 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CENPPQ6IPU0 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CENPPQ6IPU0 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CENPPQ6IPU0 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CENPPQ6IPU0 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CENPPQ6IPU0 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CENPPQ6IPU0 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CENPPQ6IPU0 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CENPPQ6IPU0 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CENPPQ6IPU0 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CENPPQ6IPU0 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CENPPQ6IPU0 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CENPPQ6IPU0 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CENPPQ6IPU0 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CENPPQ6IPU0 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CENPPQ6IPU0 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CENPPQ6IPU0 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CENPPQ6IPU0 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CENPPQ6IPU0 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CENPPQ6IPU0 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CENPPQ6IPU0 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CENPPQ6IPU0 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CENPPQ6IPU0 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CENPPQ6IPU0 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CENPPQ6IPU0 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CENPPQ6IPU0 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CENPPQ6IPU0 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CENPPQ6IPU0 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CENPPQ6IPU0 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CENPPQ6IPU0 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CENPPQ6IPU0 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CENPPQ6IPU0 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CENPPQ6IPU0 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CENPPQ6IPU0 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CENPPQ6IPU0 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CENPPQ6IPU0 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CENPPQ6IPU0 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CENPPQ6IPU0 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CENPPQ6IPU0 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CENPPQ6IPU0 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CENPPQ6IPU0 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CENPPQ6IPU0 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CENPPQ6IPU0 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CENPPQ6IPU0 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.1 ms