Protein–RNA interactions for Protein: Q68CJ9

CREB3L3, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 3-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB3L3Q68CJ9 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CREB3L3Q68CJ9 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CREB3L3Q68CJ9 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CREB3L3Q68CJ9 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CREB3L3Q68CJ9 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CREB3L3Q68CJ9 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CREB3L3Q68CJ9 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CREB3L3Q68CJ9 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
CREB3L3Q68CJ9 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CREB3L3Q68CJ9 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CREB3L3Q68CJ9 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CREB3L3Q68CJ9 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CREB3L3Q68CJ9 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CREB3L3Q68CJ9 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CREB3L3Q68CJ9 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CREB3L3Q68CJ9 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
CREB3L3Q68CJ9 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CREB3L3Q68CJ9 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CREB3L3Q68CJ9 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
CREB3L3Q68CJ9 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
CREB3L3Q68CJ9 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CREB3L3Q68CJ9 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CREB3L3Q68CJ9 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CREB3L3Q68CJ9 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CREB3L3Q68CJ9 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CREB3L3Q68CJ9 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CREB3L3Q68CJ9 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
CREB3L3Q68CJ9 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CREB3L3Q68CJ9 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CREB3L3Q68CJ9 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CREB3L3Q68CJ9 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CREB3L3Q68CJ9 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CREB3L3Q68CJ9 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
CREB3L3Q68CJ9 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CREB3L3Q68CJ9 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CREB3L3Q68CJ9 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CREB3L3Q68CJ9 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CREB3L3Q68CJ9 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CREB3L3Q68CJ9 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CREB3L3Q68CJ9 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CREB3L3Q68CJ9 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CREB3L3Q68CJ9 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CREB3L3Q68CJ9 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
CREB3L3Q68CJ9 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
CREB3L3Q68CJ9 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CREB3L3Q68CJ9 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CREB3L3Q68CJ9 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
CREB3L3Q68CJ9 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CREB3L3Q68CJ9 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CREB3L3Q68CJ9 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CREB3L3Q68CJ9 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CREB3L3Q68CJ9 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CREB3L3Q68CJ9 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CREB3L3Q68CJ9 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CREB3L3Q68CJ9 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CREB3L3Q68CJ9 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CREB3L3Q68CJ9 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CREB3L3Q68CJ9 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CREB3L3Q68CJ9 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
CREB3L3Q68CJ9 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CREB3L3Q68CJ9 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CREB3L3Q68CJ9 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
CREB3L3Q68CJ9 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
CREB3L3Q68CJ9 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CREB3L3Q68CJ9 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CREB3L3Q68CJ9 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CREB3L3Q68CJ9 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CREB3L3Q68CJ9 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CREB3L3Q68CJ9 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CREB3L3Q68CJ9 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CREB3L3Q68CJ9 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CREB3L3Q68CJ9 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CREB3L3Q68CJ9 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CREB3L3Q68CJ9 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CREB3L3Q68CJ9 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CREB3L3Q68CJ9 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CREB3L3Q68CJ9 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CREB3L3Q68CJ9 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CREB3L3Q68CJ9 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CREB3L3Q68CJ9 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CREB3L3Q68CJ9 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
CREB3L3Q68CJ9 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CREB3L3Q68CJ9 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CREB3L3Q68CJ9 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CREB3L3Q68CJ9 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CREB3L3Q68CJ9 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CREB3L3Q68CJ9 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
CREB3L3Q68CJ9 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CREB3L3Q68CJ9 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CREB3L3Q68CJ9 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CREB3L3Q68CJ9 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CREB3L3Q68CJ9 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CREB3L3Q68CJ9 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CREB3L3Q68CJ9 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CREB3L3Q68CJ9 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CREB3L3Q68CJ9 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CREB3L3Q68CJ9 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
CREB3L3Q68CJ9 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
CREB3L3Q68CJ9 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CREB3L3Q68CJ9 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.7 ms