Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTT2

C9orf135, Protein C9orf135, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf135Q5VTT2 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
C9orf135Q5VTT2 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
C9orf135Q5VTT2 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
C9orf135Q5VTT2 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
C9orf135Q5VTT2 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
C9orf135Q5VTT2 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
C9orf135Q5VTT2 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
C9orf135Q5VTT2 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
C9orf135Q5VTT2 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
C9orf135Q5VTT2 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
C9orf135Q5VTT2 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
C9orf135Q5VTT2 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
C9orf135Q5VTT2 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
C9orf135Q5VTT2 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
C9orf135Q5VTT2 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
C9orf135Q5VTT2 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
C9orf135Q5VTT2 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
C9orf135Q5VTT2 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
C9orf135Q5VTT2 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
C9orf135Q5VTT2 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
C9orf135Q5VTT2 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
C9orf135Q5VTT2 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
C9orf135Q5VTT2 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
C9orf135Q5VTT2 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
C9orf135Q5VTT2 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
C9orf135Q5VTT2 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
C9orf135Q5VTT2 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
C9orf135Q5VTT2 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
C9orf135Q5VTT2 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
C9orf135Q5VTT2 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
C9orf135Q5VTT2 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
C9orf135Q5VTT2 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
C9orf135Q5VTT2 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
C9orf135Q5VTT2 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
C9orf135Q5VTT2 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
C9orf135Q5VTT2 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
C9orf135Q5VTT2 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
C9orf135Q5VTT2 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
C9orf135Q5VTT2 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
C9orf135Q5VTT2 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
C9orf135Q5VTT2 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
C9orf135Q5VTT2 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
C9orf135Q5VTT2 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
C9orf135Q5VTT2 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
C9orf135Q5VTT2 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
C9orf135Q5VTT2 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
C9orf135Q5VTT2 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
C9orf135Q5VTT2 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
C9orf135Q5VTT2 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
C9orf135Q5VTT2 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
C9orf135Q5VTT2 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
C9orf135Q5VTT2 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
C9orf135Q5VTT2 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
C9orf135Q5VTT2 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
C9orf135Q5VTT2 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
C9orf135Q5VTT2 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
C9orf135Q5VTT2 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
C9orf135Q5VTT2 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
C9orf135Q5VTT2 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
C9orf135Q5VTT2 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
C9orf135Q5VTT2 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
C9orf135Q5VTT2 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
C9orf135Q5VTT2 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
C9orf135Q5VTT2 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
C9orf135Q5VTT2 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
C9orf135Q5VTT2 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
C9orf135Q5VTT2 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
C9orf135Q5VTT2 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
C9orf135Q5VTT2 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
C9orf135Q5VTT2 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
C9orf135Q5VTT2 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
C9orf135Q5VTT2 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
C9orf135Q5VTT2 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
C9orf135Q5VTT2 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
C9orf135Q5VTT2 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
C9orf135Q5VTT2 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
C9orf135Q5VTT2 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
C9orf135Q5VTT2 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
C9orf135Q5VTT2 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
C9orf135Q5VTT2 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
C9orf135Q5VTT2 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
C9orf135Q5VTT2 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
C9orf135Q5VTT2 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
C9orf135Q5VTT2 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
C9orf135Q5VTT2 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
C9orf135Q5VTT2 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
C9orf135Q5VTT2 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
C9orf135Q5VTT2 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
C9orf135Q5VTT2 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
C9orf135Q5VTT2 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
C9orf135Q5VTT2 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
C9orf135Q5VTT2 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
C9orf135Q5VTT2 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
C9orf135Q5VTT2 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
C9orf135Q5VTT2 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
C9orf135Q5VTT2 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
C9orf135Q5VTT2 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
C9orf135Q5VTT2 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
C9orf135Q5VTT2 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
C9orf135Q5VTT2 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms