Protein–RNA interactions for Protein: Q5T7P6

TMEM78, Transmembrane protein 78, humanhuman

Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM78Q5T7P6 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TMEM78Q5T7P6 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TMEM78Q5T7P6 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TMEM78Q5T7P6 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TMEM78Q5T7P6 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
TMEM78Q5T7P6 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
TMEM78Q5T7P6 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TMEM78Q5T7P6 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TMEM78Q5T7P6 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TMEM78Q5T7P6 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TMEM78Q5T7P6 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
TMEM78Q5T7P6 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
TMEM78Q5T7P6 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
TMEM78Q5T7P6 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM78Q5T7P6 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM78Q5T7P6 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM78Q5T7P6 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM78Q5T7P6 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM78Q5T7P6 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM78Q5T7P6 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM78Q5T7P6 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM78Q5T7P6 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM78Q5T7P6 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM78Q5T7P6 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM78Q5T7P6 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM78Q5T7P6 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM78Q5T7P6 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM78Q5T7P6 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM78Q5T7P6 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM78Q5T7P6 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM78Q5T7P6 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM78Q5T7P6 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM78Q5T7P6 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM78Q5T7P6 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM78Q5T7P6 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM78Q5T7P6 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM78Q5T7P6 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM78Q5T7P6 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM78Q5T7P6 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM78Q5T7P6 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM78Q5T7P6 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM78Q5T7P6 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM78Q5T7P6 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM78Q5T7P6 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM78Q5T7P6 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM78Q5T7P6 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM78Q5T7P6 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM78Q5T7P6 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM78Q5T7P6 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM78Q5T7P6 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM78Q5T7P6 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM78Q5T7P6 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM78Q5T7P6 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM78Q5T7P6 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM78Q5T7P6 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM78Q5T7P6 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM78Q5T7P6 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM78Q5T7P6 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM78Q5T7P6 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM78Q5T7P6 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM78Q5T7P6 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM78Q5T7P6 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM78Q5T7P6 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM78Q5T7P6 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM78Q5T7P6 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM78Q5T7P6 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM78Q5T7P6 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM78Q5T7P6 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM78Q5T7P6 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM78Q5T7P6 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM78Q5T7P6 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM78Q5T7P6 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM78Q5T7P6 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM78Q5T7P6 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM78Q5T7P6 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM78Q5T7P6 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM78Q5T7P6 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM78Q5T7P6 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM78Q5T7P6 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM78Q5T7P6 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM78Q5T7P6 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM78Q5T7P6 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM78Q5T7P6 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM78Q5T7P6 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM78Q5T7P6 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM78Q5T7P6 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM78Q5T7P6 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM78Q5T7P6 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM78Q5T7P6 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM78Q5T7P6 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM78Q5T7P6 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM78Q5T7P6 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM78Q5T7P6 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM78Q5T7P6 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM78Q5T7P6 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM78Q5T7P6 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM78Q5T7P6 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM78Q5T7P6 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM78Q5T7P6 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM78Q5T7P6 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms