Protein–RNA interactions for Protein: Q5GH77

XKR3, XK-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XKR3Q5GH77 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
XKR3Q5GH77 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
XKR3Q5GH77 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
XKR3Q5GH77 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
XKR3Q5GH77 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
XKR3Q5GH77 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
XKR3Q5GH77 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
XKR3Q5GH77 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
XKR3Q5GH77 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
XKR3Q5GH77 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
XKR3Q5GH77 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
XKR3Q5GH77 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
XKR3Q5GH77 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
XKR3Q5GH77 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
XKR3Q5GH77 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
XKR3Q5GH77 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
XKR3Q5GH77 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
XKR3Q5GH77 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
XKR3Q5GH77 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
XKR3Q5GH77 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
XKR3Q5GH77 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
XKR3Q5GH77 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
XKR3Q5GH77 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
XKR3Q5GH77 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
XKR3Q5GH77 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
XKR3Q5GH77 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
XKR3Q5GH77 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
XKR3Q5GH77 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
XKR3Q5GH77 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
XKR3Q5GH77 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
XKR3Q5GH77 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
XKR3Q5GH77 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
XKR3Q5GH77 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
XKR3Q5GH77 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
XKR3Q5GH77 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
XKR3Q5GH77 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
XKR3Q5GH77 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
XKR3Q5GH77 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
XKR3Q5GH77 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
XKR3Q5GH77 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
XKR3Q5GH77 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
XKR3Q5GH77 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
XKR3Q5GH77 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
XKR3Q5GH77 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
XKR3Q5GH77 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
XKR3Q5GH77 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
XKR3Q5GH77 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
XKR3Q5GH77 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
XKR3Q5GH77 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
XKR3Q5GH77 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
XKR3Q5GH77 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
XKR3Q5GH77 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
XKR3Q5GH77 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
XKR3Q5GH77 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
XKR3Q5GH77 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
XKR3Q5GH77 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
XKR3Q5GH77 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
XKR3Q5GH77 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
XKR3Q5GH77 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
XKR3Q5GH77 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
XKR3Q5GH77 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
XKR3Q5GH77 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
XKR3Q5GH77 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
XKR3Q5GH77 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
XKR3Q5GH77 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
XKR3Q5GH77 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
XKR3Q5GH77 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
XKR3Q5GH77 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
XKR3Q5GH77 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
XKR3Q5GH77 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
XKR3Q5GH77 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
XKR3Q5GH77 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
XKR3Q5GH77 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
XKR3Q5GH77 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
XKR3Q5GH77 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
XKR3Q5GH77 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
XKR3Q5GH77 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
XKR3Q5GH77 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
XKR3Q5GH77 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
XKR3Q5GH77 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
XKR3Q5GH77 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
XKR3Q5GH77 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
XKR3Q5GH77 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
XKR3Q5GH77 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
XKR3Q5GH77 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
XKR3Q5GH77 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
XKR3Q5GH77 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
XKR3Q5GH77 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
XKR3Q5GH77 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
XKR3Q5GH77 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
XKR3Q5GH77 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
XKR3Q5GH77 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
XKR3Q5GH77 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
XKR3Q5GH77 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
XKR3Q5GH77 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
XKR3Q5GH77 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
XKR3Q5GH77 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
XKR3Q5GH77 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
XKR3Q5GH77 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
XKR3Q5GH77 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms