Protein–RNA interactions for Protein: Q59GN2

RPL39P5, Putative 60S ribosomal protein L39-like 5, humanhuman

Predictions only

Length 51 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL39P5Q59GN2 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RPL39P5Q59GN2 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RPL39P5Q59GN2 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RPL39P5Q59GN2 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RPL39P5Q59GN2 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RPL39P5Q59GN2 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RPL39P5Q59GN2 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RPL39P5Q59GN2 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RPL39P5Q59GN2 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RPL39P5Q59GN2 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RPL39P5Q59GN2 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RPL39P5Q59GN2 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RPL39P5Q59GN2 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RPL39P5Q59GN2 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RPL39P5Q59GN2 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RPL39P5Q59GN2 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RPL39P5Q59GN2 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RPL39P5Q59GN2 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RPL39P5Q59GN2 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RPL39P5Q59GN2 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RPL39P5Q59GN2 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RPL39P5Q59GN2 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RPL39P5Q59GN2 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RPL39P5Q59GN2 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RPL39P5Q59GN2 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RPL39P5Q59GN2 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
RPL39P5Q59GN2 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RPL39P5Q59GN2 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RPL39P5Q59GN2 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RPL39P5Q59GN2 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RPL39P5Q59GN2 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RPL39P5Q59GN2 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RPL39P5Q59GN2 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RPL39P5Q59GN2 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RPL39P5Q59GN2 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RPL39P5Q59GN2 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RPL39P5Q59GN2 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RPL39P5Q59GN2 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RPL39P5Q59GN2 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RPL39P5Q59GN2 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RPL39P5Q59GN2 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RPL39P5Q59GN2 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RPL39P5Q59GN2 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RPL39P5Q59GN2 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RPL39P5Q59GN2 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RPL39P5Q59GN2 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RPL39P5Q59GN2 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RPL39P5Q59GN2 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RPL39P5Q59GN2 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RPL39P5Q59GN2 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RPL39P5Q59GN2 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RPL39P5Q59GN2 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
RPL39P5Q59GN2 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RPL39P5Q59GN2 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RPL39P5Q59GN2 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RPL39P5Q59GN2 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RPL39P5Q59GN2 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RPL39P5Q59GN2 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RPL39P5Q59GN2 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RPL39P5Q59GN2 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RPL39P5Q59GN2 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RPL39P5Q59GN2 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RPL39P5Q59GN2 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RPL39P5Q59GN2 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RPL39P5Q59GN2 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RPL39P5Q59GN2 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RPL39P5Q59GN2 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RPL39P5Q59GN2 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RPL39P5Q59GN2 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RPL39P5Q59GN2 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RPL39P5Q59GN2 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RPL39P5Q59GN2 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RPL39P5Q59GN2 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RPL39P5Q59GN2 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RPL39P5Q59GN2 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RPL39P5Q59GN2 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RPL39P5Q59GN2 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RPL39P5Q59GN2 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RPL39P5Q59GN2 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RPL39P5Q59GN2 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RPL39P5Q59GN2 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RPL39P5Q59GN2 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RPL39P5Q59GN2 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RPL39P5Q59GN2 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RPL39P5Q59GN2 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RPL39P5Q59GN2 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RPL39P5Q59GN2 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RPL39P5Q59GN2 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RPL39P5Q59GN2 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RPL39P5Q59GN2 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RPL39P5Q59GN2 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RPL39P5Q59GN2 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RPL39P5Q59GN2 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RPL39P5Q59GN2 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RPL39P5Q59GN2 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RPL39P5Q59GN2 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RPL39P5Q59GN2 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RPL39P5Q59GN2 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RPL39P5Q59GN2 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RPL39P5Q59GN2 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms