Protein–RNA interactions for Protein: Q53H82

LACTB2, Endoribonuclease LACTB2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LACTB2Q53H82 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
LACTB2Q53H82 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
LACTB2Q53H82 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
LACTB2Q53H82 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
LACTB2Q53H82 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
LACTB2Q53H82 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
LACTB2Q53H82 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
LACTB2Q53H82 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
LACTB2Q53H82 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
LACTB2Q53H82 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
LACTB2Q53H82 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
LACTB2Q53H82 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
LACTB2Q53H82 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
LACTB2Q53H82 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
LACTB2Q53H82 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
LACTB2Q53H82 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
LACTB2Q53H82 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
LACTB2Q53H82 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
LACTB2Q53H82 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
LACTB2Q53H82 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
LACTB2Q53H82 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
LACTB2Q53H82 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
LACTB2Q53H82 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
LACTB2Q53H82 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
LACTB2Q53H82 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
LACTB2Q53H82 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
LACTB2Q53H82 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
LACTB2Q53H82 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
LACTB2Q53H82 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
LACTB2Q53H82 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
LACTB2Q53H82 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
LACTB2Q53H82 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
LACTB2Q53H82 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
LACTB2Q53H82 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
LACTB2Q53H82 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
LACTB2Q53H82 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
LACTB2Q53H82 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
LACTB2Q53H82 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
LACTB2Q53H82 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
LACTB2Q53H82 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
LACTB2Q53H82 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
LACTB2Q53H82 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
LACTB2Q53H82 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
LACTB2Q53H82 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
LACTB2Q53H82 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
LACTB2Q53H82 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
LACTB2Q53H82 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
LACTB2Q53H82 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
LACTB2Q53H82 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
LACTB2Q53H82 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
LACTB2Q53H82 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
LACTB2Q53H82 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
LACTB2Q53H82 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
LACTB2Q53H82 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
LACTB2Q53H82 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
LACTB2Q53H82 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
LACTB2Q53H82 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
LACTB2Q53H82 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
LACTB2Q53H82 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
LACTB2Q53H82 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
LACTB2Q53H82 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
LACTB2Q53H82 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
LACTB2Q53H82 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
LACTB2Q53H82 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
LACTB2Q53H82 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
LACTB2Q53H82 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
LACTB2Q53H82 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
LACTB2Q53H82 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
LACTB2Q53H82 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
LACTB2Q53H82 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
LACTB2Q53H82 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LACTB2Q53H82 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LACTB2Q53H82 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LACTB2Q53H82 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
LACTB2Q53H82 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
LACTB2Q53H82 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LACTB2Q53H82 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
LACTB2Q53H82 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LACTB2Q53H82 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
LACTB2Q53H82 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
LACTB2Q53H82 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LACTB2Q53H82 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
LACTB2Q53H82 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC20.25■□□□□ 0.83
LACTB2Q53H82 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
LACTB2Q53H82 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LACTB2Q53H82 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LACTB2Q53H82 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
LACTB2Q53H82 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
LACTB2Q53H82 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
LACTB2Q53H82 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LACTB2Q53H82 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LACTB2Q53H82 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LACTB2Q53H82 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
LACTB2Q53H82 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
LACTB2Q53H82 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
LACTB2Q53H82 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LACTB2Q53H82 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
LACTB2Q53H82 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LACTB2Q53H82 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LACTB2Q53H82 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms