Protein–RNA interactions for Protein: Q4KMQ1

TPRN, Taperin, humanhuman

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Length 711 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPRNQ4KMQ1 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TPRNQ4KMQ1 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TPRNQ4KMQ1 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TPRNQ4KMQ1 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TPRNQ4KMQ1 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TPRNQ4KMQ1 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TPRNQ4KMQ1 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TPRNQ4KMQ1 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TPRNQ4KMQ1 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
TPRNQ4KMQ1 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TPRNQ4KMQ1 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TPRNQ4KMQ1 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TPRNQ4KMQ1 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TPRNQ4KMQ1 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TPRNQ4KMQ1 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TPRNQ4KMQ1 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TPRNQ4KMQ1 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TPRNQ4KMQ1 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TPRNQ4KMQ1 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TPRNQ4KMQ1 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
TPRNQ4KMQ1 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TPRNQ4KMQ1 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TPRNQ4KMQ1 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TPRNQ4KMQ1 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TPRNQ4KMQ1 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TPRNQ4KMQ1 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TPRNQ4KMQ1 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TPRNQ4KMQ1 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TPRNQ4KMQ1 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TPRNQ4KMQ1 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TPRNQ4KMQ1 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TPRNQ4KMQ1 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TPRNQ4KMQ1 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TPRNQ4KMQ1 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TPRNQ4KMQ1 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TPRNQ4KMQ1 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TPRNQ4KMQ1 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TPRNQ4KMQ1 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TPRNQ4KMQ1 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TPRNQ4KMQ1 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TPRNQ4KMQ1 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TPRNQ4KMQ1 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TPRNQ4KMQ1 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
TPRNQ4KMQ1 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TPRNQ4KMQ1 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TPRNQ4KMQ1 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TPRNQ4KMQ1 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TPRNQ4KMQ1 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TPRNQ4KMQ1 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TPRNQ4KMQ1 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TPRNQ4KMQ1 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TPRNQ4KMQ1 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TPRNQ4KMQ1 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TPRNQ4KMQ1 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TPRNQ4KMQ1 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TPRNQ4KMQ1 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TPRNQ4KMQ1 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TPRNQ4KMQ1 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TPRNQ4KMQ1 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TPRNQ4KMQ1 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TPRNQ4KMQ1 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TPRNQ4KMQ1 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TPRNQ4KMQ1 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TPRNQ4KMQ1 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TPRNQ4KMQ1 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TPRNQ4KMQ1 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TPRNQ4KMQ1 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TPRNQ4KMQ1 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TPRNQ4KMQ1 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TPRNQ4KMQ1 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TPRNQ4KMQ1 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TPRNQ4KMQ1 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
TPRNQ4KMQ1 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TPRNQ4KMQ1 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TPRNQ4KMQ1 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TPRNQ4KMQ1 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TPRNQ4KMQ1 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
TPRNQ4KMQ1 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TPRNQ4KMQ1 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TPRNQ4KMQ1 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TPRNQ4KMQ1 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TPRNQ4KMQ1 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
TPRNQ4KMQ1 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TPRNQ4KMQ1 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TPRNQ4KMQ1 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
TPRNQ4KMQ1 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TPRNQ4KMQ1 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TPRNQ4KMQ1 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TPRNQ4KMQ1 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TPRNQ4KMQ1 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TPRNQ4KMQ1 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TPRNQ4KMQ1 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TPRNQ4KMQ1 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TPRNQ4KMQ1 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TPRNQ4KMQ1 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TPRNQ4KMQ1 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TPRNQ4KMQ1 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TPRNQ4KMQ1 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TPRNQ4KMQ1 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TPRNQ4KMQ1 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
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