Protein–RNA interactions for Protein: Q4G0W2

DUSP28, Dual specificity phosphatase 28, humanhuman

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP28Q4G0W2 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
DUSP28Q4G0W2 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
DUSP28Q4G0W2 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
DUSP28Q4G0W2 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
DUSP28Q4G0W2 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
DUSP28Q4G0W2 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
DUSP28Q4G0W2 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
DUSP28Q4G0W2 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
DUSP28Q4G0W2 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
DUSP28Q4G0W2 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
DUSP28Q4G0W2 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
DUSP28Q4G0W2 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
DUSP28Q4G0W2 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
DUSP28Q4G0W2 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
DUSP28Q4G0W2 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
DUSP28Q4G0W2 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
DUSP28Q4G0W2 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
DUSP28Q4G0W2 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
DUSP28Q4G0W2 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
DUSP28Q4G0W2 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
DUSP28Q4G0W2 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DUSP28Q4G0W2 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DUSP28Q4G0W2 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
DUSP28Q4G0W2 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
DUSP28Q4G0W2 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DUSP28Q4G0W2 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DUSP28Q4G0W2 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
DUSP28Q4G0W2 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DUSP28Q4G0W2 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DUSP28Q4G0W2 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
DUSP28Q4G0W2 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
DUSP28Q4G0W2 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
DUSP28Q4G0W2 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
DUSP28Q4G0W2 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DUSP28Q4G0W2 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DUSP28Q4G0W2 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DUSP28Q4G0W2 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
DUSP28Q4G0W2 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DUSP28Q4G0W2 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
DUSP28Q4G0W2 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
DUSP28Q4G0W2 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
DUSP28Q4G0W2 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
DUSP28Q4G0W2 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
DUSP28Q4G0W2 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
DUSP28Q4G0W2 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
DUSP28Q4G0W2 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
DUSP28Q4G0W2 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
DUSP28Q4G0W2 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
DUSP28Q4G0W2 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
DUSP28Q4G0W2 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
DUSP28Q4G0W2 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
DUSP28Q4G0W2 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
DUSP28Q4G0W2 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
DUSP28Q4G0W2 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
DUSP28Q4G0W2 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
DUSP28Q4G0W2 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
DUSP28Q4G0W2 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
DUSP28Q4G0W2 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
DUSP28Q4G0W2 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
DUSP28Q4G0W2 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
DUSP28Q4G0W2 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
DUSP28Q4G0W2 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
DUSP28Q4G0W2 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
DUSP28Q4G0W2 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
DUSP28Q4G0W2 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
DUSP28Q4G0W2 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
DUSP28Q4G0W2 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
DUSP28Q4G0W2 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
DUSP28Q4G0W2 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
DUSP28Q4G0W2 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
DUSP28Q4G0W2 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
DUSP28Q4G0W2 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
DUSP28Q4G0W2 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
DUSP28Q4G0W2 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
DUSP28Q4G0W2 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
DUSP28Q4G0W2 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
DUSP28Q4G0W2 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
DUSP28Q4G0W2 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
DUSP28Q4G0W2 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
DUSP28Q4G0W2 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
DUSP28Q4G0W2 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
DUSP28Q4G0W2 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
DUSP28Q4G0W2 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
DUSP28Q4G0W2 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
DUSP28Q4G0W2 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
DUSP28Q4G0W2 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
DUSP28Q4G0W2 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
DUSP28Q4G0W2 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
DUSP28Q4G0W2 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DUSP28Q4G0W2 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
DUSP28Q4G0W2 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
DUSP28Q4G0W2 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
DUSP28Q4G0W2 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DUSP28Q4G0W2 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DUSP28Q4G0W2 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
DUSP28Q4G0W2 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DUSP28Q4G0W2 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
DUSP28Q4G0W2 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DUSP28Q4G0W2 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
DUSP28Q4G0W2 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms