Protein–RNA interactions for Protein: Q496Y0

LONRF3, LON peptidase N-terminal domain and RING finger protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 759 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LONRF3Q496Y0 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LONRF3Q496Y0 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LONRF3Q496Y0 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
LONRF3Q496Y0 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LONRF3Q496Y0 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LONRF3Q496Y0 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LONRF3Q496Y0 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LONRF3Q496Y0 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LONRF3Q496Y0 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LONRF3Q496Y0 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LONRF3Q496Y0 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LONRF3Q496Y0 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LONRF3Q496Y0 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LONRF3Q496Y0 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LONRF3Q496Y0 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LONRF3Q496Y0 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LONRF3Q496Y0 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LONRF3Q496Y0 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LONRF3Q496Y0 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LONRF3Q496Y0 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LONRF3Q496Y0 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LONRF3Q496Y0 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LONRF3Q496Y0 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LONRF3Q496Y0 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LONRF3Q496Y0 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LONRF3Q496Y0 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LONRF3Q496Y0 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
LONRF3Q496Y0 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LONRF3Q496Y0 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LONRF3Q496Y0 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LONRF3Q496Y0 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LONRF3Q496Y0 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LONRF3Q496Y0 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LONRF3Q496Y0 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LONRF3Q496Y0 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LONRF3Q496Y0 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LONRF3Q496Y0 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LONRF3Q496Y0 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LONRF3Q496Y0 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LONRF3Q496Y0 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LONRF3Q496Y0 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LONRF3Q496Y0 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LONRF3Q496Y0 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LONRF3Q496Y0 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LONRF3Q496Y0 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LONRF3Q496Y0 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
LONRF3Q496Y0 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LONRF3Q496Y0 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LONRF3Q496Y0 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LONRF3Q496Y0 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LONRF3Q496Y0 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LONRF3Q496Y0 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LONRF3Q496Y0 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LONRF3Q496Y0 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LONRF3Q496Y0 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LONRF3Q496Y0 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LONRF3Q496Y0 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LONRF3Q496Y0 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LONRF3Q496Y0 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LONRF3Q496Y0 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LONRF3Q496Y0 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LONRF3Q496Y0 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LONRF3Q496Y0 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LONRF3Q496Y0 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LONRF3Q496Y0 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
LONRF3Q496Y0 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LONRF3Q496Y0 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
LONRF3Q496Y0 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LONRF3Q496Y0 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
LONRF3Q496Y0 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LONRF3Q496Y0 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LONRF3Q496Y0 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
LONRF3Q496Y0 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
LONRF3Q496Y0 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
LONRF3Q496Y0 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
LONRF3Q496Y0 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LONRF3Q496Y0 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LONRF3Q496Y0 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LONRF3Q496Y0 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LONRF3Q496Y0 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LONRF3Q496Y0 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LONRF3Q496Y0 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LONRF3Q496Y0 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LONRF3Q496Y0 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LONRF3Q496Y0 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LONRF3Q496Y0 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LONRF3Q496Y0 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LONRF3Q496Y0 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LONRF3Q496Y0 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LONRF3Q496Y0 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
LONRF3Q496Y0 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
LONRF3Q496Y0 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LONRF3Q496Y0 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LONRF3Q496Y0 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LONRF3Q496Y0 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
LONRF3Q496Y0 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LONRF3Q496Y0 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LONRF3Q496Y0 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LONRF3Q496Y0 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LONRF3Q496Y0 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms