Protein–RNA interactions for Protein: Q2NKQ1

SGSM1, Small G protein signaling modulator 1, humanhuman

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Length 1,148 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGSM1Q2NKQ1 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SGSM1Q2NKQ1 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SGSM1Q2NKQ1 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SGSM1Q2NKQ1 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SGSM1Q2NKQ1 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SGSM1Q2NKQ1 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SGSM1Q2NKQ1 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SGSM1Q2NKQ1 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SGSM1Q2NKQ1 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SGSM1Q2NKQ1 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
SGSM1Q2NKQ1 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SGSM1Q2NKQ1 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
SGSM1Q2NKQ1 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SGSM1Q2NKQ1 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SGSM1Q2NKQ1 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SGSM1Q2NKQ1 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SGSM1Q2NKQ1 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SGSM1Q2NKQ1 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SGSM1Q2NKQ1 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SGSM1Q2NKQ1 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SGSM1Q2NKQ1 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SGSM1Q2NKQ1 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
SGSM1Q2NKQ1 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SGSM1Q2NKQ1 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SGSM1Q2NKQ1 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SGSM1Q2NKQ1 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SGSM1Q2NKQ1 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SGSM1Q2NKQ1 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SGSM1Q2NKQ1 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SGSM1Q2NKQ1 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SGSM1Q2NKQ1 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SGSM1Q2NKQ1 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SGSM1Q2NKQ1 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SGSM1Q2NKQ1 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SGSM1Q2NKQ1 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SGSM1Q2NKQ1 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SGSM1Q2NKQ1 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SGSM1Q2NKQ1 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SGSM1Q2NKQ1 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SGSM1Q2NKQ1 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SGSM1Q2NKQ1 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SGSM1Q2NKQ1 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SGSM1Q2NKQ1 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SGSM1Q2NKQ1 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
SGSM1Q2NKQ1 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SGSM1Q2NKQ1 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SGSM1Q2NKQ1 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SGSM1Q2NKQ1 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SGSM1Q2NKQ1 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SGSM1Q2NKQ1 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SGSM1Q2NKQ1 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SGSM1Q2NKQ1 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SGSM1Q2NKQ1 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SGSM1Q2NKQ1 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SGSM1Q2NKQ1 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SGSM1Q2NKQ1 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SGSM1Q2NKQ1 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SGSM1Q2NKQ1 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SGSM1Q2NKQ1 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SGSM1Q2NKQ1 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SGSM1Q2NKQ1 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SGSM1Q2NKQ1 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SGSM1Q2NKQ1 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SGSM1Q2NKQ1 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SGSM1Q2NKQ1 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SGSM1Q2NKQ1 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SGSM1Q2NKQ1 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SGSM1Q2NKQ1 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SGSM1Q2NKQ1 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SGSM1Q2NKQ1 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SGSM1Q2NKQ1 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SGSM1Q2NKQ1 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SGSM1Q2NKQ1 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SGSM1Q2NKQ1 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SGSM1Q2NKQ1 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SGSM1Q2NKQ1 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SGSM1Q2NKQ1 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SGSM1Q2NKQ1 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SGSM1Q2NKQ1 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SGSM1Q2NKQ1 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SGSM1Q2NKQ1 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SGSM1Q2NKQ1 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SGSM1Q2NKQ1 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SGSM1Q2NKQ1 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SGSM1Q2NKQ1 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SGSM1Q2NKQ1 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
SGSM1Q2NKQ1 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SGSM1Q2NKQ1 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SGSM1Q2NKQ1 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SGSM1Q2NKQ1 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SGSM1Q2NKQ1 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SGSM1Q2NKQ1 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
SGSM1Q2NKQ1 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
SGSM1Q2NKQ1 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SGSM1Q2NKQ1 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SGSM1Q2NKQ1 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SGSM1Q2NKQ1 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SGSM1Q2NKQ1 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SGSM1Q2NKQ1 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
SGSM1Q2NKQ1 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
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