Protein–RNA interactions for Protein: Q1T7F1

Putative chemokine-related protein B42, humanhuman

Predictions only

Length 81 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q1T7F1 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Q1T7F1 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Q1T7F1 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Q1T7F1 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Q1T7F1 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Q1T7F1 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Q1T7F1 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Q1T7F1 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Q1T7F1 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Q1T7F1 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Q1T7F1 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Q1T7F1 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Q1T7F1 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Q1T7F1 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Q1T7F1 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Q1T7F1 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Q1T7F1 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Q1T7F1 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Q1T7F1 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Q1T7F1 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Q1T7F1 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Q1T7F1 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Q1T7F1 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Q1T7F1 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Q1T7F1 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Q1T7F1 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Q1T7F1 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Q1T7F1 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Q1T7F1 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Q1T7F1 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Q1T7F1 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Q1T7F1 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Q1T7F1 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Q1T7F1 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Q1T7F1 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Q1T7F1 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Q1T7F1 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Q1T7F1 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Q1T7F1 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Q1T7F1 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Q1T7F1 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Q1T7F1 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Q1T7F1 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Q1T7F1 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Q1T7F1 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Q1T7F1 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Q1T7F1 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Q1T7F1 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Q1T7F1 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Q1T7F1 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Q1T7F1 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Q1T7F1 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Q1T7F1 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Q1T7F1 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Q1T7F1 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Q1T7F1 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Q1T7F1 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Q1T7F1 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Q1T7F1 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Q1T7F1 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Q1T7F1 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Q1T7F1 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Q1T7F1 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Q1T7F1 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Q1T7F1 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Q1T7F1 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Q1T7F1 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Q1T7F1 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Q1T7F1 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Q1T7F1 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Q1T7F1 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Q1T7F1 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Q1T7F1 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Q1T7F1 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Q1T7F1 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Q1T7F1 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Q1T7F1 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Q1T7F1 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Q1T7F1 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Q1T7F1 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Q1T7F1 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Q1T7F1 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Q1T7F1 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Q1T7F1 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Q1T7F1 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Q1T7F1 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Q1T7F1 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Q1T7F1 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Q1T7F1 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Q1T7F1 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Q1T7F1 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Q1T7F1 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Q1T7F1 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Q1T7F1 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Q1T7F1 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Q1T7F1 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Q1T7F1 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Q1T7F1 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Q1T7F1 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Q1T7F1 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
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