Protein–RNA interactions for Protein: Q16875

PFKFB3, 6-phosphofructo-2-kinase/fructose-2,6-bisphosphatase 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 520 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PFKFB3Q16875 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PFKFB3Q16875 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
PFKFB3Q16875 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PFKFB3Q16875 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PFKFB3Q16875 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PFKFB3Q16875 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PFKFB3Q16875 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PFKFB3Q16875 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PFKFB3Q16875 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PFKFB3Q16875 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PFKFB3Q16875 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PFKFB3Q16875 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
PFKFB3Q16875 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PFKFB3Q16875 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
PFKFB3Q16875 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PFKFB3Q16875 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PFKFB3Q16875 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PFKFB3Q16875 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PFKFB3Q16875 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PFKFB3Q16875 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PFKFB3Q16875 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PFKFB3Q16875 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PFKFB3Q16875 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PFKFB3Q16875 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PFKFB3Q16875 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PFKFB3Q16875 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PFKFB3Q16875 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PFKFB3Q16875 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PFKFB3Q16875 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PFKFB3Q16875 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PFKFB3Q16875 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PFKFB3Q16875 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PFKFB3Q16875 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PFKFB3Q16875 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PFKFB3Q16875 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PFKFB3Q16875 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PFKFB3Q16875 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PFKFB3Q16875 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PFKFB3Q16875 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PFKFB3Q16875 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PFKFB3Q16875 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
PFKFB3Q16875 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PFKFB3Q16875 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PFKFB3Q16875 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PFKFB3Q16875 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PFKFB3Q16875 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PFKFB3Q16875 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PFKFB3Q16875 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PFKFB3Q16875 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PFKFB3Q16875 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PFKFB3Q16875 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PFKFB3Q16875 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
PFKFB3Q16875 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PFKFB3Q16875 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PFKFB3Q16875 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PFKFB3Q16875 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
PFKFB3Q16875 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
PFKFB3Q16875 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PFKFB3Q16875 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PFKFB3Q16875 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PFKFB3Q16875 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PFKFB3Q16875 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PFKFB3Q16875 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PFKFB3Q16875 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PFKFB3Q16875 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PFKFB3Q16875 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PFKFB3Q16875 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
PFKFB3Q16875 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PFKFB3Q16875 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PFKFB3Q16875 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PFKFB3Q16875 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PFKFB3Q16875 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PFKFB3Q16875 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PFKFB3Q16875 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PFKFB3Q16875 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PFKFB3Q16875 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PFKFB3Q16875 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PFKFB3Q16875 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PFKFB3Q16875 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PFKFB3Q16875 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PFKFB3Q16875 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PFKFB3Q16875 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PFKFB3Q16875 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PFKFB3Q16875 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PFKFB3Q16875 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PFKFB3Q16875 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PFKFB3Q16875 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PFKFB3Q16875 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PFKFB3Q16875 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PFKFB3Q16875 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PFKFB3Q16875 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PFKFB3Q16875 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PFKFB3Q16875 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PFKFB3Q16875 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PFKFB3Q16875 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PFKFB3Q16875 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
PFKFB3Q16875 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PFKFB3Q16875 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PFKFB3Q16875 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PFKFB3Q16875 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms