Protein–RNA interactions for Protein: Q16527

CSRP2, Cysteine and glycine-rich protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSRP2Q16527 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
CSRP2Q16527 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CSRP2Q16527 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CSRP2Q16527 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CSRP2Q16527 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CSRP2Q16527 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CSRP2Q16527 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CSRP2Q16527 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CSRP2Q16527 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CSRP2Q16527 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CSRP2Q16527 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CSRP2Q16527 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CSRP2Q16527 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CSRP2Q16527 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CSRP2Q16527 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CSRP2Q16527 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CSRP2Q16527 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CSRP2Q16527 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CSRP2Q16527 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CSRP2Q16527 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
CSRP2Q16527 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CSRP2Q16527 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CSRP2Q16527 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CSRP2Q16527 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CSRP2Q16527 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CSRP2Q16527 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CSRP2Q16527 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CSRP2Q16527 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CSRP2Q16527 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CSRP2Q16527 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CSRP2Q16527 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CSRP2Q16527 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CSRP2Q16527 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CSRP2Q16527 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CSRP2Q16527 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CSRP2Q16527 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CSRP2Q16527 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CSRP2Q16527 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
CSRP2Q16527 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
CSRP2Q16527 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
CSRP2Q16527 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CSRP2Q16527 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CSRP2Q16527 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CSRP2Q16527 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CSRP2Q16527 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CSRP2Q16527 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CSRP2Q16527 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CSRP2Q16527 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CSRP2Q16527 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CSRP2Q16527 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CSRP2Q16527 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CSRP2Q16527 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
CSRP2Q16527 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CSRP2Q16527 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
CSRP2Q16527 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CSRP2Q16527 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CSRP2Q16527 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CSRP2Q16527 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CSRP2Q16527 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CSRP2Q16527 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CSRP2Q16527 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CSRP2Q16527 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CSRP2Q16527 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CSRP2Q16527 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CSRP2Q16527 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
CSRP2Q16527 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CSRP2Q16527 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CSRP2Q16527 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CSRP2Q16527 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CSRP2Q16527 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CSRP2Q16527 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CSRP2Q16527 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CSRP2Q16527 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
CSRP2Q16527 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
CSRP2Q16527 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
CSRP2Q16527 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CSRP2Q16527 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CSRP2Q16527 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
CSRP2Q16527 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CSRP2Q16527 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CSRP2Q16527 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CSRP2Q16527 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CSRP2Q16527 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CSRP2Q16527 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CSRP2Q16527 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CSRP2Q16527 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CSRP2Q16527 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CSRP2Q16527 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CSRP2Q16527 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CSRP2Q16527 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CSRP2Q16527 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CSRP2Q16527 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CSRP2Q16527 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CSRP2Q16527 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CSRP2Q16527 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CSRP2Q16527 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CSRP2Q16527 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
CSRP2Q16527 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CSRP2Q16527 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
CSRP2Q16527 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms