Protein–RNA interactions for Protein: Q16204

CCDC6, Coiled-coil domain-containing protein 6, humanhuman

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Length 474 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC6Q16204 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CCDC6Q16204 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
CCDC6Q16204 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CCDC6Q16204 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CCDC6Q16204 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CCDC6Q16204 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CCDC6Q16204 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CCDC6Q16204 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CCDC6Q16204 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CCDC6Q16204 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCDC6Q16204 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCDC6Q16204 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCDC6Q16204 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCDC6Q16204 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCDC6Q16204 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCDC6Q16204 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCDC6Q16204 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCDC6Q16204 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCDC6Q16204 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
CCDC6Q16204 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCDC6Q16204 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCDC6Q16204 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
CCDC6Q16204 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCDC6Q16204 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
CCDC6Q16204 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCDC6Q16204 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCDC6Q16204 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCDC6Q16204 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCDC6Q16204 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
CCDC6Q16204 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCDC6Q16204 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCDC6Q16204 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCDC6Q16204 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCDC6Q16204 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCDC6Q16204 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCDC6Q16204 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCDC6Q16204 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCDC6Q16204 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCDC6Q16204 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCDC6Q16204 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCDC6Q16204 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCDC6Q16204 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCDC6Q16204 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCDC6Q16204 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCDC6Q16204 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCDC6Q16204 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCDC6Q16204 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCDC6Q16204 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
CCDC6Q16204 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCDC6Q16204 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCDC6Q16204 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCDC6Q16204 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCDC6Q16204 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC6Q16204 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC6Q16204 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC6Q16204 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC6Q16204 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC6Q16204 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC6Q16204 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC6Q16204 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC6Q16204 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC6Q16204 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC6Q16204 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC6Q16204 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC6Q16204 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC6Q16204 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC6Q16204 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC6Q16204 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
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CCDC6Q16204 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC6Q16204 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC6Q16204 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC6Q16204 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC6Q16204 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC6Q16204 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC6Q16204 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC6Q16204 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC6Q16204 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC6Q16204 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC6Q16204 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC6Q16204 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC6Q16204 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC6Q16204 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC6Q16204 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC6Q16204 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC6Q16204 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC6Q16204 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC6Q16204 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC6Q16204 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC6Q16204 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC6Q16204 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC6Q16204 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC6Q16204 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC6Q16204 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC6Q16204 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC6Q16204 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC6Q16204 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC6Q16204 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC6Q16204 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC6Q16204 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
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