Protein–RNA interactions for Protein: Q15915

ZIC1, Zinc finger protein ZIC 1, humanhuman

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIC1Q15915 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ZIC1Q15915 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ZIC1Q15915 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ZIC1Q15915 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ZIC1Q15915 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ZIC1Q15915 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ZIC1Q15915 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ZIC1Q15915 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ZIC1Q15915 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ZIC1Q15915 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ZIC1Q15915 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ZIC1Q15915 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ZIC1Q15915 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ZIC1Q15915 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ZIC1Q15915 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ZIC1Q15915 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ZIC1Q15915 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
ZIC1Q15915 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ZIC1Q15915 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ZIC1Q15915 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ZIC1Q15915 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
ZIC1Q15915 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ZIC1Q15915 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
ZIC1Q15915 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ZIC1Q15915 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ZIC1Q15915 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ZIC1Q15915 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ZIC1Q15915 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ZIC1Q15915 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ZIC1Q15915 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ZIC1Q15915 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ZIC1Q15915 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ZIC1Q15915 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ZIC1Q15915 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ZIC1Q15915 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ZIC1Q15915 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ZIC1Q15915 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ZIC1Q15915 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ZIC1Q15915 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ZIC1Q15915 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ZIC1Q15915 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ZIC1Q15915 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ZIC1Q15915 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ZIC1Q15915 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ZIC1Q15915 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ZIC1Q15915 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ZIC1Q15915 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ZIC1Q15915 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ZIC1Q15915 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ZIC1Q15915 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ZIC1Q15915 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ZIC1Q15915 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ZIC1Q15915 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ZIC1Q15915 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ZIC1Q15915 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ZIC1Q15915 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ZIC1Q15915 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ZIC1Q15915 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ZIC1Q15915 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ZIC1Q15915 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ZIC1Q15915 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ZIC1Q15915 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ZIC1Q15915 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ZIC1Q15915 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ZIC1Q15915 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ZIC1Q15915 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ZIC1Q15915 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ZIC1Q15915 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
ZIC1Q15915 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ZIC1Q15915 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ZIC1Q15915 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ZIC1Q15915 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ZIC1Q15915 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ZIC1Q15915 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ZIC1Q15915 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ZIC1Q15915 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ZIC1Q15915 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ZIC1Q15915 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ZIC1Q15915 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ZIC1Q15915 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ZIC1Q15915 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ZIC1Q15915 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ZIC1Q15915 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ZIC1Q15915 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ZIC1Q15915 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ZIC1Q15915 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ZIC1Q15915 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ZIC1Q15915 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ZIC1Q15915 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ZIC1Q15915 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
ZIC1Q15915 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ZIC1Q15915 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ZIC1Q15915 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ZIC1Q15915 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ZIC1Q15915 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ZIC1Q15915 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ZIC1Q15915 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ZIC1Q15915 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ZIC1Q15915 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ZIC1Q15915 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms