Protein–RNA interactions for Protein: Q15811

ITSN1, Intersectin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,721 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITSN1Q15811 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
ITSN1Q15811 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
ITSN1Q15811 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC27.64■■■□□ 2.01
ITSN1Q15811 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
ITSN1Q15811 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC27.64■■■□□ 2.01
ITSN1Q15811 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.01
ITSN1Q15811 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
ITSN1Q15811 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ITSN1Q15811 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ITSN1Q15811 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
ITSN1Q15811 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ITSN1Q15811 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ITSN1Q15811 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
ITSN1Q15811 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ITSN1Q15811 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
ITSN1Q15811 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC27.63■■■□□ 2.01
ITSN1Q15811 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ITSN1Q15811 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ITSN1Q15811 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ITSN1Q15811 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
ITSN1Q15811 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
ITSN1Q15811 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ITSN1Q15811 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ITSN1Q15811 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
ITSN1Q15811 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
ITSN1Q15811 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
ITSN1Q15811 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
ITSN1Q15811 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
ITSN1Q15811 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ITSN1Q15811 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ITSN1Q15811 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ITSN1Q15811 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
ITSN1Q15811 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ITSN1Q15811 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
ITSN1Q15811 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
ITSN1Q15811 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC27.61■■■□□ 2.01
ITSN1Q15811 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC27.61■■■□□ 2.01
ITSN1Q15811 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ITSN1Q15811 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
ITSN1Q15811 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
ITSN1Q15811 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ITSN1Q15811 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ITSN1Q15811 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
ITSN1Q15811 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
ITSN1Q15811 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
ITSN1Q15811 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
ITSN1Q15811 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ITSN1Q15811 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
ITSN1Q15811 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
ITSN1Q15811 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
ITSN1Q15811 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ITSN1Q15811 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ITSN1Q15811 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ITSN1Q15811 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ITSN1Q15811 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ITSN1Q15811 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
ITSN1Q15811 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ITSN1Q15811 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ITSN1Q15811 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
ITSN1Q15811 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
ITSN1Q15811 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ITSN1Q15811 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ITSN1Q15811 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ITSN1Q15811 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ITSN1Q15811 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
ITSN1Q15811 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ITSN1Q15811 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ITSN1Q15811 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
ITSN1Q15811 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ITSN1Q15811 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ITSN1Q15811 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
ITSN1Q15811 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
ITSN1Q15811 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
ITSN1Q15811 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
ITSN1Q15811 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ITSN1Q15811 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ITSN1Q15811 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ITSN1Q15811 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ITSN1Q15811 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ITSN1Q15811 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
ITSN1Q15811 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
ITSN1Q15811 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ITSN1Q15811 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ITSN1Q15811 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
ITSN1Q15811 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ITSN1Q15811 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ITSN1Q15811 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ITSN1Q15811 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ITSN1Q15811 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ITSN1Q15811 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC27.57■■■□□ 2
ITSN1Q15811 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ITSN1Q15811 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
ITSN1Q15811 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC27.57■■■□□ 2
ITSN1Q15811 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
ITSN1Q15811 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
ITSN1Q15811 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
ITSN1Q15811 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
ITSN1Q15811 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ITSN1Q15811 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
ITSN1Q15811 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
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