Protein–RNA interactions for Protein: Q15649

ZNHIT3, Zinc finger HIT domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 155 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNHIT3Q15649 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ZNHIT3Q15649 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ZNHIT3Q15649 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ZNHIT3Q15649 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ZNHIT3Q15649 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ZNHIT3Q15649 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ZNHIT3Q15649 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ZNHIT3Q15649 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ZNHIT3Q15649 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ZNHIT3Q15649 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ZNHIT3Q15649 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ZNHIT3Q15649 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ZNHIT3Q15649 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ZNHIT3Q15649 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ZNHIT3Q15649 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ZNHIT3Q15649 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ZNHIT3Q15649 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
ZNHIT3Q15649 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ZNHIT3Q15649 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ZNHIT3Q15649 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ZNHIT3Q15649 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ZNHIT3Q15649 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ZNHIT3Q15649 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ZNHIT3Q15649 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ZNHIT3Q15649 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ZNHIT3Q15649 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ZNHIT3Q15649 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ZNHIT3Q15649 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ZNHIT3Q15649 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ZNHIT3Q15649 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ZNHIT3Q15649 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ZNHIT3Q15649 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ZNHIT3Q15649 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ZNHIT3Q15649 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ZNHIT3Q15649 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ZNHIT3Q15649 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ZNHIT3Q15649 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ZNHIT3Q15649 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
ZNHIT3Q15649 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
ZNHIT3Q15649 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
ZNHIT3Q15649 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ZNHIT3Q15649 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ZNHIT3Q15649 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ZNHIT3Q15649 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ZNHIT3Q15649 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ZNHIT3Q15649 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ZNHIT3Q15649 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ZNHIT3Q15649 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ZNHIT3Q15649 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
ZNHIT3Q15649 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ZNHIT3Q15649 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ZNHIT3Q15649 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ZNHIT3Q15649 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ZNHIT3Q15649 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ZNHIT3Q15649 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ZNHIT3Q15649 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ZNHIT3Q15649 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ZNHIT3Q15649 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ZNHIT3Q15649 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ZNHIT3Q15649 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ZNHIT3Q15649 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ZNHIT3Q15649 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ZNHIT3Q15649 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ZNHIT3Q15649 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ZNHIT3Q15649 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ZNHIT3Q15649 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ZNHIT3Q15649 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ZNHIT3Q15649 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ZNHIT3Q15649 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
ZNHIT3Q15649 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ZNHIT3Q15649 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ZNHIT3Q15649 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
ZNHIT3Q15649 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ZNHIT3Q15649 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
ZNHIT3Q15649 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
ZNHIT3Q15649 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ZNHIT3Q15649 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ZNHIT3Q15649 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ZNHIT3Q15649 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ZNHIT3Q15649 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
ZNHIT3Q15649 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ZNHIT3Q15649 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ZNHIT3Q15649 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ZNHIT3Q15649 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ZNHIT3Q15649 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ZNHIT3Q15649 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ZNHIT3Q15649 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZNHIT3Q15649 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZNHIT3Q15649 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZNHIT3Q15649 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZNHIT3Q15649 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZNHIT3Q15649 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZNHIT3Q15649 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZNHIT3Q15649 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZNHIT3Q15649 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZNHIT3Q15649 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZNHIT3Q15649 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZNHIT3Q15649 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
ZNHIT3Q15649 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZNHIT3Q15649 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
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