Protein–RNA interactions for Protein: Q15628

TRADD, Tumor necrosis factor receptor type 1-associated DEATH domain protein, humanhuman

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Length 312 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRADDQ15628 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TRADDQ15628 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TRADDQ15628 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
TRADDQ15628 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TRADDQ15628 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TRADDQ15628 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TRADDQ15628 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TRADDQ15628 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TRADDQ15628 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TRADDQ15628 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TRADDQ15628 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TRADDQ15628 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TRADDQ15628 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TRADDQ15628 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TRADDQ15628 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TRADDQ15628 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TRADDQ15628 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TRADDQ15628 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TRADDQ15628 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TRADDQ15628 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TRADDQ15628 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TRADDQ15628 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TRADDQ15628 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TRADDQ15628 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TRADDQ15628 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TRADDQ15628 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TRADDQ15628 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TRADDQ15628 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TRADDQ15628 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
TRADDQ15628 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
TRADDQ15628 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TRADDQ15628 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
TRADDQ15628 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TRADDQ15628 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TRADDQ15628 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TRADDQ15628 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TRADDQ15628 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TRADDQ15628 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TRADDQ15628 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TRADDQ15628 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TRADDQ15628 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TRADDQ15628 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TRADDQ15628 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
TRADDQ15628 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TRADDQ15628 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TRADDQ15628 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TRADDQ15628 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TRADDQ15628 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
TRADDQ15628 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TRADDQ15628 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TRADDQ15628 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TRADDQ15628 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TRADDQ15628 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TRADDQ15628 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TRADDQ15628 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TRADDQ15628 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TRADDQ15628 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TRADDQ15628 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TRADDQ15628 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TRADDQ15628 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
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TRADDQ15628 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TRADDQ15628 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TRADDQ15628 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
TRADDQ15628 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TRADDQ15628 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TRADDQ15628 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
TRADDQ15628 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TRADDQ15628 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TRADDQ15628 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TRADDQ15628 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TRADDQ15628 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TRADDQ15628 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TRADDQ15628 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TRADDQ15628 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TRADDQ15628 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TRADDQ15628 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TRADDQ15628 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TRADDQ15628 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TRADDQ15628 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TRADDQ15628 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TRADDQ15628 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TRADDQ15628 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TRADDQ15628 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TRADDQ15628 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TRADDQ15628 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
TRADDQ15628 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TRADDQ15628 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TRADDQ15628 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TRADDQ15628 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TRADDQ15628 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TRADDQ15628 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TRADDQ15628 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
TRADDQ15628 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
TRADDQ15628 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
TRADDQ15628 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
TRADDQ15628 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TRADDQ15628 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TRADDQ15628 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TRADDQ15628 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
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