Protein–RNA interactions for Protein: Q15475

SIX1, Homeobox protein SIX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX1Q15475 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SIX1Q15475 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SIX1Q15475 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SIX1Q15475 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SIX1Q15475 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SIX1Q15475 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SIX1Q15475 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SIX1Q15475 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SIX1Q15475 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SIX1Q15475 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SIX1Q15475 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SIX1Q15475 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SIX1Q15475 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
SIX1Q15475 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SIX1Q15475 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SIX1Q15475 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SIX1Q15475 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SIX1Q15475 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SIX1Q15475 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SIX1Q15475 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SIX1Q15475 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SIX1Q15475 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SIX1Q15475 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SIX1Q15475 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SIX1Q15475 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SIX1Q15475 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SIX1Q15475 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SIX1Q15475 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SIX1Q15475 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SIX1Q15475 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SIX1Q15475 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SIX1Q15475 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SIX1Q15475 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SIX1Q15475 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SIX1Q15475 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SIX1Q15475 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SIX1Q15475 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SIX1Q15475 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SIX1Q15475 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
SIX1Q15475 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SIX1Q15475 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SIX1Q15475 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SIX1Q15475 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SIX1Q15475 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SIX1Q15475 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SIX1Q15475 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SIX1Q15475 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SIX1Q15475 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SIX1Q15475 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SIX1Q15475 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SIX1Q15475 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SIX1Q15475 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SIX1Q15475 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
SIX1Q15475 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SIX1Q15475 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SIX1Q15475 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SIX1Q15475 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SIX1Q15475 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SIX1Q15475 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SIX1Q15475 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
SIX1Q15475 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SIX1Q15475 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SIX1Q15475 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SIX1Q15475 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SIX1Q15475 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SIX1Q15475 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SIX1Q15475 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SIX1Q15475 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SIX1Q15475 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
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SIX1Q15475 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
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SIX1Q15475 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SIX1Q15475 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SIX1Q15475 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SIX1Q15475 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SIX1Q15475 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SIX1Q15475 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SIX1Q15475 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SIX1Q15475 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SIX1Q15475 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SIX1Q15475 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SIX1Q15475 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SIX1Q15475 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SIX1Q15475 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SIX1Q15475 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SIX1Q15475 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SIX1Q15475 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SIX1Q15475 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SIX1Q15475 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SIX1Q15475 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SIX1Q15475 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SIX1Q15475 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
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