Protein–RNA interactions for Protein: Q15361

TTF1, Transcription termination factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 905 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTF1Q15361 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TTF1Q15361 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TTF1Q15361 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TTF1Q15361 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
TTF1Q15361 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TTF1Q15361 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TTF1Q15361 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TTF1Q15361 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TTF1Q15361 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TTF1Q15361 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TTF1Q15361 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TTF1Q15361 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TTF1Q15361 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TTF1Q15361 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TTF1Q15361 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TTF1Q15361 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TTF1Q15361 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
TTF1Q15361 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TTF1Q15361 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TTF1Q15361 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
TTF1Q15361 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TTF1Q15361 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TTF1Q15361 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TTF1Q15361 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TTF1Q15361 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TTF1Q15361 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TTF1Q15361 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TTF1Q15361 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TTF1Q15361 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TTF1Q15361 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TTF1Q15361 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TTF1Q15361 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TTF1Q15361 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TTF1Q15361 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TTF1Q15361 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TTF1Q15361 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TTF1Q15361 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TTF1Q15361 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TTF1Q15361 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TTF1Q15361 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TTF1Q15361 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TTF1Q15361 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TTF1Q15361 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TTF1Q15361 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TTF1Q15361 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TTF1Q15361 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TTF1Q15361 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TTF1Q15361 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TTF1Q15361 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TTF1Q15361 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TTF1Q15361 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TTF1Q15361 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TTF1Q15361 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TTF1Q15361 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TTF1Q15361 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TTF1Q15361 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TTF1Q15361 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TTF1Q15361 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TTF1Q15361 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TTF1Q15361 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TTF1Q15361 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TTF1Q15361 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TTF1Q15361 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TTF1Q15361 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TTF1Q15361 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TTF1Q15361 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TTF1Q15361 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TTF1Q15361 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TTF1Q15361 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TTF1Q15361 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TTF1Q15361 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TTF1Q15361 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TTF1Q15361 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TTF1Q15361 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TTF1Q15361 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TTF1Q15361 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
TTF1Q15361 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TTF1Q15361 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
TTF1Q15361 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TTF1Q15361 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TTF1Q15361 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TTF1Q15361 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TTF1Q15361 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TTF1Q15361 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
TTF1Q15361 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TTF1Q15361 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TTF1Q15361 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TTF1Q15361 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TTF1Q15361 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TTF1Q15361 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TTF1Q15361 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TTF1Q15361 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TTF1Q15361 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TTF1Q15361 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TTF1Q15361 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TTF1Q15361 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TTF1Q15361 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TTF1Q15361 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TTF1Q15361 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TTF1Q15361 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
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