Protein–RNA interactions for Protein: Q149N8

SHPRH, E3 ubiquitin-protein ligase SHPRH, humanhuman

Predictions only

Length 1,683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHPRHQ149N8 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SHPRHQ149N8 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC28■■■□□ 2.07
SHPRHQ149N8 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SHPRHQ149N8 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
SHPRHQ149N8 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SHPRHQ149N8 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SHPRHQ149N8 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SHPRHQ149N8 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SHPRHQ149N8 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SHPRHQ149N8 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SHPRHQ149N8 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SHPRHQ149N8 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
SHPRHQ149N8 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SHPRHQ149N8 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SHPRHQ149N8 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SHPRHQ149N8 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SHPRHQ149N8 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SHPRHQ149N8 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SHPRHQ149N8 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SHPRHQ149N8 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SHPRHQ149N8 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SHPRHQ149N8 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SHPRHQ149N8 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SHPRHQ149N8 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SHPRHQ149N8 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SHPRHQ149N8 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SHPRHQ149N8 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SHPRHQ149N8 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SHPRHQ149N8 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SHPRHQ149N8 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SHPRHQ149N8 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SHPRHQ149N8 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SHPRHQ149N8 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SHPRHQ149N8 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SHPRHQ149N8 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
SHPRHQ149N8 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SHPRHQ149N8 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SHPRHQ149N8 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SHPRHQ149N8 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SHPRHQ149N8 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SHPRHQ149N8 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SHPRHQ149N8 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SHPRHQ149N8 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SHPRHQ149N8 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SHPRHQ149N8 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SHPRHQ149N8 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SHPRHQ149N8 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SHPRHQ149N8 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SHPRHQ149N8 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
SHPRHQ149N8 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SHPRHQ149N8 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SHPRHQ149N8 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SHPRHQ149N8 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SHPRHQ149N8 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SHPRHQ149N8 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SHPRHQ149N8 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SHPRHQ149N8 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SHPRHQ149N8 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SHPRHQ149N8 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.07
SHPRHQ149N8 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.07
SHPRHQ149N8 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
SHPRHQ149N8 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
SHPRHQ149N8 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
SHPRHQ149N8 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
SHPRHQ149N8 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
SHPRHQ149N8 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
SHPRHQ149N8 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
SHPRHQ149N8 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
SHPRHQ149N8 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
SHPRHQ149N8 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC27.95■■■□□ 2.07
SHPRHQ149N8 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
SHPRHQ149N8 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC27.95■■■□□ 2.07
SHPRHQ149N8 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
SHPRHQ149N8 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
SHPRHQ149N8 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
SHPRHQ149N8 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SHPRHQ149N8 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SHPRHQ149N8 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SHPRHQ149N8 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SHPRHQ149N8 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SHPRHQ149N8 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SHPRHQ149N8 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
SHPRHQ149N8 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
SHPRHQ149N8 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SHPRHQ149N8 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SHPRHQ149N8 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SHPRHQ149N8 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SHPRHQ149N8 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SHPRHQ149N8 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SHPRHQ149N8 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SHPRHQ149N8 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SHPRHQ149N8 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SHPRHQ149N8 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SHPRHQ149N8 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SHPRHQ149N8 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SHPRHQ149N8 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SHPRHQ149N8 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SHPRHQ149N8 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SHPRHQ149N8 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SHPRHQ149N8 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
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