Protein–RNA interactions for Protein: Q14213

EBI3, Interleukin-27 subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBI3Q14213 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EBI3Q14213 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EBI3Q14213 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
EBI3Q14213 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
EBI3Q14213 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
EBI3Q14213 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
EBI3Q14213 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
EBI3Q14213 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EBI3Q14213 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EBI3Q14213 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EBI3Q14213 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EBI3Q14213 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EBI3Q14213 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
EBI3Q14213 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
EBI3Q14213 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
EBI3Q14213 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
EBI3Q14213 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
EBI3Q14213 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
EBI3Q14213 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
EBI3Q14213 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
EBI3Q14213 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
EBI3Q14213 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
EBI3Q14213 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EBI3Q14213 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
EBI3Q14213 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EBI3Q14213 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
EBI3Q14213 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
EBI3Q14213 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EBI3Q14213 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
EBI3Q14213 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
EBI3Q14213 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EBI3Q14213 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EBI3Q14213 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EBI3Q14213 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EBI3Q14213 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EBI3Q14213 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EBI3Q14213 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EBI3Q14213 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EBI3Q14213 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EBI3Q14213 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
EBI3Q14213 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
EBI3Q14213 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC16■□□□□ 0.15
EBI3Q14213 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
EBI3Q14213 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
EBI3Q14213 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
EBI3Q14213 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
EBI3Q14213 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EBI3Q14213 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EBI3Q14213 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EBI3Q14213 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EBI3Q14213 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
EBI3Q14213 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
EBI3Q14213 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EBI3Q14213 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EBI3Q14213 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EBI3Q14213 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EBI3Q14213 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EBI3Q14213 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EBI3Q14213 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
EBI3Q14213 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EBI3Q14213 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EBI3Q14213 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EBI3Q14213 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EBI3Q14213 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EBI3Q14213 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EBI3Q14213 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EBI3Q14213 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EBI3Q14213 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EBI3Q14213 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EBI3Q14213 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EBI3Q14213 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EBI3Q14213 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EBI3Q14213 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EBI3Q14213 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EBI3Q14213 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EBI3Q14213 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EBI3Q14213 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EBI3Q14213 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EBI3Q14213 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EBI3Q14213 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EBI3Q14213 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EBI3Q14213 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EBI3Q14213 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EBI3Q14213 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EBI3Q14213 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EBI3Q14213 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EBI3Q14213 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EBI3Q14213 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EBI3Q14213 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EBI3Q14213 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EBI3Q14213 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EBI3Q14213 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EBI3Q14213 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EBI3Q14213 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EBI3Q14213 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EBI3Q14213 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EBI3Q14213 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EBI3Q14213 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EBI3Q14213 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EBI3Q14213 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms