Protein–RNA interactions for Protein: Q13956

PDE6H, Retinal cone rhodopsin-sensitive cGMP 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit gamma, humanhuman

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Length 83 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE6HQ13956 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PDE6HQ13956 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PDE6HQ13956 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PDE6HQ13956 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PDE6HQ13956 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PDE6HQ13956 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PDE6HQ13956 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PDE6HQ13956 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PDE6HQ13956 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PDE6HQ13956 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PDE6HQ13956 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PDE6HQ13956 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PDE6HQ13956 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PDE6HQ13956 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PDE6HQ13956 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PDE6HQ13956 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PDE6HQ13956 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PDE6HQ13956 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PDE6HQ13956 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PDE6HQ13956 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PDE6HQ13956 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PDE6HQ13956 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
PDE6HQ13956 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PDE6HQ13956 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PDE6HQ13956 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PDE6HQ13956 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PDE6HQ13956 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PDE6HQ13956 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PDE6HQ13956 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PDE6HQ13956 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PDE6HQ13956 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PDE6HQ13956 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PDE6HQ13956 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PDE6HQ13956 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PDE6HQ13956 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PDE6HQ13956 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PDE6HQ13956 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PDE6HQ13956 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PDE6HQ13956 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PDE6HQ13956 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PDE6HQ13956 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
PDE6HQ13956 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PDE6HQ13956 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PDE6HQ13956 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PDE6HQ13956 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PDE6HQ13956 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PDE6HQ13956 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PDE6HQ13956 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PDE6HQ13956 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PDE6HQ13956 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PDE6HQ13956 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PDE6HQ13956 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PDE6HQ13956 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PDE6HQ13956 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PDE6HQ13956 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PDE6HQ13956 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PDE6HQ13956 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PDE6HQ13956 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PDE6HQ13956 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PDE6HQ13956 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PDE6HQ13956 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PDE6HQ13956 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
PDE6HQ13956 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PDE6HQ13956 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PDE6HQ13956 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PDE6HQ13956 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PDE6HQ13956 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PDE6HQ13956 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PDE6HQ13956 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PDE6HQ13956 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PDE6HQ13956 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PDE6HQ13956 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PDE6HQ13956 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PDE6HQ13956 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PDE6HQ13956 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PDE6HQ13956 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PDE6HQ13956 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PDE6HQ13956 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PDE6HQ13956 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PDE6HQ13956 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PDE6HQ13956 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PDE6HQ13956 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PDE6HQ13956 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PDE6HQ13956 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PDE6HQ13956 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PDE6HQ13956 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PDE6HQ13956 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PDE6HQ13956 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PDE6HQ13956 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PDE6HQ13956 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PDE6HQ13956 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PDE6HQ13956 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PDE6HQ13956 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PDE6HQ13956 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PDE6HQ13956 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PDE6HQ13956 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PDE6HQ13956 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PDE6HQ13956 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PDE6HQ13956 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
PDE6HQ13956 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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