Protein–RNA interactions for Protein: Q13868

EXOSC2, Exosome complex component RRP4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC2Q13868 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
EXOSC2Q13868 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
EXOSC2Q13868 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
EXOSC2Q13868 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
EXOSC2Q13868 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
EXOSC2Q13868 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
EXOSC2Q13868 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
EXOSC2Q13868 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
EXOSC2Q13868 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
EXOSC2Q13868 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
EXOSC2Q13868 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
EXOSC2Q13868 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
EXOSC2Q13868 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
EXOSC2Q13868 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
EXOSC2Q13868 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
EXOSC2Q13868 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
EXOSC2Q13868 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
EXOSC2Q13868 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
EXOSC2Q13868 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
EXOSC2Q13868 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
EXOSC2Q13868 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
EXOSC2Q13868 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
EXOSC2Q13868 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
EXOSC2Q13868 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
EXOSC2Q13868 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
EXOSC2Q13868 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
EXOSC2Q13868 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
EXOSC2Q13868 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
EXOSC2Q13868 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
EXOSC2Q13868 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
EXOSC2Q13868 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
EXOSC2Q13868 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
EXOSC2Q13868 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
EXOSC2Q13868 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
EXOSC2Q13868 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
EXOSC2Q13868 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
EXOSC2Q13868 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
EXOSC2Q13868 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
EXOSC2Q13868 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
EXOSC2Q13868 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
EXOSC2Q13868 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
EXOSC2Q13868 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
EXOSC2Q13868 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
EXOSC2Q13868 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
EXOSC2Q13868 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
EXOSC2Q13868 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
EXOSC2Q13868 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
EXOSC2Q13868 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
EXOSC2Q13868 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
EXOSC2Q13868 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
EXOSC2Q13868 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
EXOSC2Q13868 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
EXOSC2Q13868 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
EXOSC2Q13868 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
EXOSC2Q13868 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
EXOSC2Q13868 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
EXOSC2Q13868 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
EXOSC2Q13868 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
EXOSC2Q13868 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
EXOSC2Q13868 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
EXOSC2Q13868 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
EXOSC2Q13868 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
EXOSC2Q13868 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
EXOSC2Q13868 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
EXOSC2Q13868 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
EXOSC2Q13868 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
EXOSC2Q13868 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
EXOSC2Q13868 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
EXOSC2Q13868 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
EXOSC2Q13868 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
EXOSC2Q13868 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
EXOSC2Q13868 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
EXOSC2Q13868 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
EXOSC2Q13868 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
EXOSC2Q13868 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
EXOSC2Q13868 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
EXOSC2Q13868 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
EXOSC2Q13868 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
EXOSC2Q13868 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
EXOSC2Q13868 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
EXOSC2Q13868 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
EXOSC2Q13868 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
EXOSC2Q13868 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
EXOSC2Q13868 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
EXOSC2Q13868 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
EXOSC2Q13868 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
EXOSC2Q13868 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
EXOSC2Q13868 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
EXOSC2Q13868 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
EXOSC2Q13868 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
EXOSC2Q13868 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
EXOSC2Q13868 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
EXOSC2Q13868 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
EXOSC2Q13868 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
EXOSC2Q13868 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
EXOSC2Q13868 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
EXOSC2Q13868 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
EXOSC2Q13868 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
EXOSC2Q13868 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
EXOSC2Q13868 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
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