Protein–RNA interactions for Protein: Q13639

HTR4, 5-hydroxytryptamine receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTR4Q13639 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
HTR4Q13639 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
HTR4Q13639 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
HTR4Q13639 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
HTR4Q13639 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
HTR4Q13639 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
HTR4Q13639 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
HTR4Q13639 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
HTR4Q13639 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
HTR4Q13639 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
HTR4Q13639 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
HTR4Q13639 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
HTR4Q13639 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
HTR4Q13639 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
HTR4Q13639 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
HTR4Q13639 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
HTR4Q13639 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
HTR4Q13639 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
HTR4Q13639 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
HTR4Q13639 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
HTR4Q13639 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
HTR4Q13639 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
HTR4Q13639 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
HTR4Q13639 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
HTR4Q13639 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
HTR4Q13639 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
HTR4Q13639 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
HTR4Q13639 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
HTR4Q13639 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
HTR4Q13639 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
HTR4Q13639 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
HTR4Q13639 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
HTR4Q13639 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
HTR4Q13639 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
HTR4Q13639 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
HTR4Q13639 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
HTR4Q13639 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
HTR4Q13639 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
HTR4Q13639 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
HTR4Q13639 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
HTR4Q13639 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
HTR4Q13639 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
HTR4Q13639 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
HTR4Q13639 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
HTR4Q13639 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
HTR4Q13639 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
HTR4Q13639 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
HTR4Q13639 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
HTR4Q13639 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
HTR4Q13639 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
HTR4Q13639 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC20.68■□□□□ 0.9
HTR4Q13639 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
HTR4Q13639 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC20.68■□□□□ 0.9
HTR4Q13639 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
HTR4Q13639 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC20.68■□□□□ 0.9
HTR4Q13639 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
HTR4Q13639 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
HTR4Q13639 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC20.68■□□□□ 0.9
HTR4Q13639 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
HTR4Q13639 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
HTR4Q13639 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
HTR4Q13639 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC20.68■□□□□ 0.9
HTR4Q13639 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
HTR4Q13639 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
HTR4Q13639 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
HTR4Q13639 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
HTR4Q13639 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
HTR4Q13639 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
HTR4Q13639 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
HTR4Q13639 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
HTR4Q13639 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC20.67■□□□□ 0.9
HTR4Q13639 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
HTR4Q13639 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
HTR4Q13639 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
HTR4Q13639 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
HTR4Q13639 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
HTR4Q13639 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
HTR4Q13639 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
HTR4Q13639 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
HTR4Q13639 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
HTR4Q13639 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
HTR4Q13639 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
HTR4Q13639 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
HTR4Q13639 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
HTR4Q13639 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
HTR4Q13639 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
HTR4Q13639 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
HTR4Q13639 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
HTR4Q13639 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
HTR4Q13639 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
HTR4Q13639 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
HTR4Q13639 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
HTR4Q13639 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
HTR4Q13639 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
HTR4Q13639 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
HTR4Q13639 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
HTR4Q13639 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
HTR4Q13639 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
HTR4Q13639 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
HTR4Q13639 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
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