Protein–RNA interactions for Protein: Q13616

CUL1, Cullin-1, humanhuman

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Length 776 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL1Q13616 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CUL1Q13616 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CUL1Q13616 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
CUL1Q13616 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CUL1Q13616 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CUL1Q13616 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CUL1Q13616 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CUL1Q13616 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CUL1Q13616 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CUL1Q13616 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CUL1Q13616 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CUL1Q13616 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CUL1Q13616 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CUL1Q13616 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CUL1Q13616 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CUL1Q13616 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
CUL1Q13616 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CUL1Q13616 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CUL1Q13616 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CUL1Q13616 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CUL1Q13616 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CUL1Q13616 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CUL1Q13616 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CUL1Q13616 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CUL1Q13616 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CUL1Q13616 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CUL1Q13616 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
CUL1Q13616 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CUL1Q13616 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CUL1Q13616 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CUL1Q13616 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CUL1Q13616 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
CUL1Q13616 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CUL1Q13616 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
CUL1Q13616 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
CUL1Q13616 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
CUL1Q13616 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CUL1Q13616 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CUL1Q13616 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CUL1Q13616 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CUL1Q13616 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CUL1Q13616 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CUL1Q13616 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CUL1Q13616 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CUL1Q13616 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CUL1Q13616 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CUL1Q13616 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CUL1Q13616 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
CUL1Q13616 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CUL1Q13616 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CUL1Q13616 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CUL1Q13616 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CUL1Q13616 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CUL1Q13616 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CUL1Q13616 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CUL1Q13616 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
CUL1Q13616 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CUL1Q13616 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CUL1Q13616 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CUL1Q13616 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CUL1Q13616 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CUL1Q13616 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CUL1Q13616 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CUL1Q13616 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CUL1Q13616 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CUL1Q13616 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CUL1Q13616 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CUL1Q13616 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CUL1Q13616 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CUL1Q13616 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CUL1Q13616 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CUL1Q13616 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CUL1Q13616 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CUL1Q13616 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CUL1Q13616 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CUL1Q13616 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CUL1Q13616 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CUL1Q13616 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CUL1Q13616 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CUL1Q13616 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CUL1Q13616 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CUL1Q13616 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CUL1Q13616 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CUL1Q13616 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CUL1Q13616 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CUL1Q13616 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CUL1Q13616 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CUL1Q13616 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CUL1Q13616 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CUL1Q13616 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CUL1Q13616 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CUL1Q13616 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
CUL1Q13616 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CUL1Q13616 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CUL1Q13616 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CUL1Q13616 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CUL1Q13616 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CUL1Q13616 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CUL1Q13616 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CUL1Q13616 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
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