Protein–RNA interactions for Protein: Q13601

KRR1, KRR1 small subunit processome component homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 381 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRR1Q13601 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
KRR1Q13601 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
KRR1Q13601 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
KRR1Q13601 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
KRR1Q13601 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
KRR1Q13601 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
KRR1Q13601 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
KRR1Q13601 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
KRR1Q13601 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
KRR1Q13601 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
KRR1Q13601 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
KRR1Q13601 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
KRR1Q13601 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KRR1Q13601 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KRR1Q13601 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KRR1Q13601 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KRR1Q13601 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KRR1Q13601 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KRR1Q13601 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KRR1Q13601 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KRR1Q13601 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KRR1Q13601 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KRR1Q13601 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KRR1Q13601 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KRR1Q13601 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KRR1Q13601 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KRR1Q13601 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KRR1Q13601 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KRR1Q13601 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KRR1Q13601 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KRR1Q13601 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
KRR1Q13601 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KRR1Q13601 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KRR1Q13601 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
KRR1Q13601 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KRR1Q13601 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KRR1Q13601 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KRR1Q13601 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KRR1Q13601 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KRR1Q13601 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KRR1Q13601 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KRR1Q13601 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KRR1Q13601 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KRR1Q13601 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KRR1Q13601 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KRR1Q13601 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KRR1Q13601 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KRR1Q13601 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KRR1Q13601 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KRR1Q13601 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KRR1Q13601 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KRR1Q13601 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KRR1Q13601 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KRR1Q13601 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KRR1Q13601 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KRR1Q13601 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KRR1Q13601 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KRR1Q13601 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KRR1Q13601 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KRR1Q13601 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KRR1Q13601 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KRR1Q13601 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KRR1Q13601 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KRR1Q13601 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KRR1Q13601 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KRR1Q13601 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KRR1Q13601 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KRR1Q13601 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KRR1Q13601 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KRR1Q13601 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KRR1Q13601 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KRR1Q13601 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KRR1Q13601 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KRR1Q13601 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KRR1Q13601 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KRR1Q13601 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KRR1Q13601 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KRR1Q13601 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KRR1Q13601 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KRR1Q13601 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KRR1Q13601 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
KRR1Q13601 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KRR1Q13601 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KRR1Q13601 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KRR1Q13601 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KRR1Q13601 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KRR1Q13601 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KRR1Q13601 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KRR1Q13601 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KRR1Q13601 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KRR1Q13601 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KRR1Q13601 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KRR1Q13601 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
KRR1Q13601 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KRR1Q13601 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KRR1Q13601 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KRR1Q13601 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KRR1Q13601 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KRR1Q13601 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KRR1Q13601 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
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