Protein–RNA interactions for Protein: Q13564

NAE1, NEDD8-activating enzyme E1 regulatory subunit, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NAE1Q13564 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
NAE1Q13564 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
NAE1Q13564 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
NAE1Q13564 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
NAE1Q13564 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
NAE1Q13564 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
NAE1Q13564 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
NAE1Q13564 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
NAE1Q13564 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
NAE1Q13564 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
NAE1Q13564 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
NAE1Q13564 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
NAE1Q13564 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
NAE1Q13564 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
NAE1Q13564 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
NAE1Q13564 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
NAE1Q13564 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
NAE1Q13564 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
NAE1Q13564 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
NAE1Q13564 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
NAE1Q13564 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
NAE1Q13564 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
NAE1Q13564 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
NAE1Q13564 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
NAE1Q13564 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
NAE1Q13564 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
NAE1Q13564 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
NAE1Q13564 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
NAE1Q13564 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
NAE1Q13564 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
NAE1Q13564 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
NAE1Q13564 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
NAE1Q13564 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
NAE1Q13564 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
NAE1Q13564 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
NAE1Q13564 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
NAE1Q13564 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
NAE1Q13564 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
NAE1Q13564 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
NAE1Q13564 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
NAE1Q13564 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
NAE1Q13564 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
NAE1Q13564 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
NAE1Q13564 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
NAE1Q13564 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
NAE1Q13564 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
NAE1Q13564 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
NAE1Q13564 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
NAE1Q13564 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
NAE1Q13564 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
NAE1Q13564 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
NAE1Q13564 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NAE1Q13564 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NAE1Q13564 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NAE1Q13564 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NAE1Q13564 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
NAE1Q13564 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
NAE1Q13564 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NAE1Q13564 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
NAE1Q13564 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
NAE1Q13564 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
NAE1Q13564 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
NAE1Q13564 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
NAE1Q13564 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
NAE1Q13564 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
NAE1Q13564 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
NAE1Q13564 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NAE1Q13564 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
NAE1Q13564 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
NAE1Q13564 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
NAE1Q13564 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NAE1Q13564 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
NAE1Q13564 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
NAE1Q13564 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NAE1Q13564 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NAE1Q13564 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NAE1Q13564 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NAE1Q13564 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NAE1Q13564 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NAE1Q13564 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NAE1Q13564 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NAE1Q13564 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NAE1Q13564 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NAE1Q13564 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
NAE1Q13564 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NAE1Q13564 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NAE1Q13564 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NAE1Q13564 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NAE1Q13564 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NAE1Q13564 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
NAE1Q13564 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
NAE1Q13564 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
NAE1Q13564 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NAE1Q13564 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
NAE1Q13564 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NAE1Q13564 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NAE1Q13564 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NAE1Q13564 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NAE1Q13564 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NAE1Q13564 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms