Protein–RNA interactions for Protein: Q13496

MTM1, Myotubularin, humanhuman

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Length 603 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTM1Q13496 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
MTM1Q13496 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
MTM1Q13496 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
MTM1Q13496 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
MTM1Q13496 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
MTM1Q13496 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
MTM1Q13496 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
MTM1Q13496 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
MTM1Q13496 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
MTM1Q13496 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
MTM1Q13496 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
MTM1Q13496 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
MTM1Q13496 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
MTM1Q13496 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
MTM1Q13496 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
MTM1Q13496 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
MTM1Q13496 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
MTM1Q13496 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
MTM1Q13496 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
MTM1Q13496 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
MTM1Q13496 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
MTM1Q13496 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
MTM1Q13496 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
MTM1Q13496 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
MTM1Q13496 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
MTM1Q13496 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
MTM1Q13496 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
MTM1Q13496 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
MTM1Q13496 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
MTM1Q13496 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
MTM1Q13496 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
MTM1Q13496 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
MTM1Q13496 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
MTM1Q13496 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
MTM1Q13496 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
MTM1Q13496 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
MTM1Q13496 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
MTM1Q13496 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
MTM1Q13496 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
MTM1Q13496 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
MTM1Q13496 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
MTM1Q13496 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
MTM1Q13496 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
MTM1Q13496 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
MTM1Q13496 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
MTM1Q13496 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
MTM1Q13496 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
MTM1Q13496 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
MTM1Q13496 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
MTM1Q13496 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
MTM1Q13496 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
MTM1Q13496 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
MTM1Q13496 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
MTM1Q13496 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
MTM1Q13496 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
MTM1Q13496 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
MTM1Q13496 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
MTM1Q13496 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
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MTM1Q13496 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
MTM1Q13496 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
MTM1Q13496 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
MTM1Q13496 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
MTM1Q13496 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
MTM1Q13496 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
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MTM1Q13496 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
MTM1Q13496 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
MTM1Q13496 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
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MTM1Q13496 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
MTM1Q13496 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
MTM1Q13496 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
MTM1Q13496 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
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MTM1Q13496 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
MTM1Q13496 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
MTM1Q13496 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
MTM1Q13496 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
MTM1Q13496 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
MTM1Q13496 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
MTM1Q13496 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
MTM1Q13496 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
MTM1Q13496 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
MTM1Q13496 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
MTM1Q13496 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
MTM1Q13496 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
MTM1Q13496 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
MTM1Q13496 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
MTM1Q13496 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
MTM1Q13496 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
MTM1Q13496 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
MTM1Q13496 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
MTM1Q13496 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
MTM1Q13496 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
MTM1Q13496 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
MTM1Q13496 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
MTM1Q13496 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
MTM1Q13496 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
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