Protein–RNA interactions for Protein: Q13286

CLN3, Battenin, humanhuman

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3Q13286 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CLN3Q13286 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CLN3Q13286 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CLN3Q13286 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CLN3Q13286 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
CLN3Q13286 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CLN3Q13286 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
CLN3Q13286 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CLN3Q13286 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CLN3Q13286 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
CLN3Q13286 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
CLN3Q13286 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
CLN3Q13286 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
CLN3Q13286 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CLN3Q13286 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CLN3Q13286 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CLN3Q13286 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CLN3Q13286 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CLN3Q13286 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CLN3Q13286 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CLN3Q13286 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CLN3Q13286 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CLN3Q13286 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CLN3Q13286 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CLN3Q13286 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CLN3Q13286 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CLN3Q13286 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CLN3Q13286 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CLN3Q13286 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CLN3Q13286 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CLN3Q13286 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CLN3Q13286 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CLN3Q13286 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CLN3Q13286 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CLN3Q13286 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CLN3Q13286 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CLN3Q13286 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CLN3Q13286 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CLN3Q13286 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CLN3Q13286 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
CLN3Q13286 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CLN3Q13286 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CLN3Q13286 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
CLN3Q13286 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CLN3Q13286 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CLN3Q13286 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CLN3Q13286 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CLN3Q13286 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CLN3Q13286 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CLN3Q13286 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CLN3Q13286 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CLN3Q13286 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CLN3Q13286 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CLN3Q13286 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CLN3Q13286 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CLN3Q13286 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CLN3Q13286 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CLN3Q13286 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CLN3Q13286 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
CLN3Q13286 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
CLN3Q13286 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
CLN3Q13286 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CLN3Q13286 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CLN3Q13286 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CLN3Q13286 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CLN3Q13286 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CLN3Q13286 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CLN3Q13286 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CLN3Q13286 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CLN3Q13286 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CLN3Q13286 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
CLN3Q13286 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CLN3Q13286 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CLN3Q13286 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CLN3Q13286 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CLN3Q13286 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
CLN3Q13286 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CLN3Q13286 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CLN3Q13286 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CLN3Q13286 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CLN3Q13286 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CLN3Q13286 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CLN3Q13286 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CLN3Q13286 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CLN3Q13286 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CLN3Q13286 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CLN3Q13286 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CLN3Q13286 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CLN3Q13286 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CLN3Q13286 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CLN3Q13286 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CLN3Q13286 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
CLN3Q13286 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CLN3Q13286 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CLN3Q13286 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CLN3Q13286 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CLN3Q13286 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CLN3Q13286 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CLN3Q13286 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
CLN3Q13286 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
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