Protein–RNA interactions for Protein: Q13185

CBX3, Chromobox protein homolog 3, humanhuman

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Length 183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX3Q13185 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CBX3Q13185 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CBX3Q13185 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CBX3Q13185 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CBX3Q13185 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CBX3Q13185 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
CBX3Q13185 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CBX3Q13185 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CBX3Q13185 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CBX3Q13185 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CBX3Q13185 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CBX3Q13185 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CBX3Q13185 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
CBX3Q13185 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CBX3Q13185 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CBX3Q13185 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CBX3Q13185 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CBX3Q13185 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CBX3Q13185 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CBX3Q13185 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CBX3Q13185 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
CBX3Q13185 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CBX3Q13185 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
CBX3Q13185 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CBX3Q13185 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
CBX3Q13185 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CBX3Q13185 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CBX3Q13185 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CBX3Q13185 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CBX3Q13185 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CBX3Q13185 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CBX3Q13185 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CBX3Q13185 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CBX3Q13185 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CBX3Q13185 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CBX3Q13185 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CBX3Q13185 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CBX3Q13185 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
CBX3Q13185 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CBX3Q13185 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CBX3Q13185 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CBX3Q13185 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
CBX3Q13185 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
CBX3Q13185 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
CBX3Q13185 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
CBX3Q13185 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CBX3Q13185 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
CBX3Q13185 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CBX3Q13185 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CBX3Q13185 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CBX3Q13185 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CBX3Q13185 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CBX3Q13185 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CBX3Q13185 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CBX3Q13185 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CBX3Q13185 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CBX3Q13185 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CBX3Q13185 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CBX3Q13185 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CBX3Q13185 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CBX3Q13185 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CBX3Q13185 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CBX3Q13185 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
CBX3Q13185 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CBX3Q13185 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CBX3Q13185 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CBX3Q13185 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CBX3Q13185 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CBX3Q13185 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CBX3Q13185 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CBX3Q13185 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CBX3Q13185 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CBX3Q13185 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
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CBX3Q13185 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
CBX3Q13185 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
CBX3Q13185 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
CBX3Q13185 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
CBX3Q13185 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
CBX3Q13185 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CBX3Q13185 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CBX3Q13185 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
CBX3Q13185 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CBX3Q13185 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CBX3Q13185 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CBX3Q13185 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CBX3Q13185 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CBX3Q13185 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CBX3Q13185 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
CBX3Q13185 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CBX3Q13185 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CBX3Q13185 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CBX3Q13185 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CBX3Q13185 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CBX3Q13185 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CBX3Q13185 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
CBX3Q13185 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CBX3Q13185 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
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