Protein–RNA interactions for Protein: Q12829

RAB40B, Ras-related protein Rab-40B, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB40BQ12829 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
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RAB40BQ12829 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RAB40BQ12829 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RAB40BQ12829 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RAB40BQ12829 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RAB40BQ12829 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RAB40BQ12829 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RAB40BQ12829 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
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RAB40BQ12829 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAB40BQ12829 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAB40BQ12829 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
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RAB40BQ12829 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
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RAB40BQ12829 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
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RAB40BQ12829 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
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RAB40BQ12829 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RAB40BQ12829 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RAB40BQ12829 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RAB40BQ12829 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RAB40BQ12829 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RAB40BQ12829 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RAB40BQ12829 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RAB40BQ12829 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RAB40BQ12829 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RAB40BQ12829 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
RAB40BQ12829 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
RAB40BQ12829 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
RAB40BQ12829 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
RAB40BQ12829 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.46
RAB40BQ12829 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
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