Protein–RNA interactions for Protein: Q12791

KCNMA1, Calcium-activated potassium channel subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,236 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMA1Q12791 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
KCNMA1Q12791 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
KCNMA1Q12791 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
KCNMA1Q12791 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
KCNMA1Q12791 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
KCNMA1Q12791 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
KCNMA1Q12791 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
KCNMA1Q12791 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
KCNMA1Q12791 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
KCNMA1Q12791 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
KCNMA1Q12791 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
KCNMA1Q12791 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
KCNMA1Q12791 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
KCNMA1Q12791 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
KCNMA1Q12791 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
KCNMA1Q12791 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
KCNMA1Q12791 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
KCNMA1Q12791 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
KCNMA1Q12791 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
KCNMA1Q12791 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
KCNMA1Q12791 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
KCNMA1Q12791 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
KCNMA1Q12791 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
KCNMA1Q12791 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
KCNMA1Q12791 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
KCNMA1Q12791 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
KCNMA1Q12791 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
KCNMA1Q12791 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
KCNMA1Q12791 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
KCNMA1Q12791 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
KCNMA1Q12791 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
KCNMA1Q12791 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
KCNMA1Q12791 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
KCNMA1Q12791 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
KCNMA1Q12791 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
KCNMA1Q12791 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
KCNMA1Q12791 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC21.77■■□□□ 1.08
KCNMA1Q12791 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
KCNMA1Q12791 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
KCNMA1Q12791 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
KCNMA1Q12791 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
KCNMA1Q12791 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
KCNMA1Q12791 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
KCNMA1Q12791 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
KCNMA1Q12791 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
KCNMA1Q12791 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
KCNMA1Q12791 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
KCNMA1Q12791 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
KCNMA1Q12791 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
KCNMA1Q12791 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
KCNMA1Q12791 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
KCNMA1Q12791 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
KCNMA1Q12791 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
KCNMA1Q12791 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
KCNMA1Q12791 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
KCNMA1Q12791 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
KCNMA1Q12791 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
KCNMA1Q12791 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
KCNMA1Q12791 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
KCNMA1Q12791 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
KCNMA1Q12791 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
KCNMA1Q12791 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
KCNMA1Q12791 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
KCNMA1Q12791 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
KCNMA1Q12791 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
KCNMA1Q12791 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
KCNMA1Q12791 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
KCNMA1Q12791 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
KCNMA1Q12791 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
KCNMA1Q12791 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
KCNMA1Q12791 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
KCNMA1Q12791 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
KCNMA1Q12791 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
KCNMA1Q12791 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
KCNMA1Q12791 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
KCNMA1Q12791 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
KCNMA1Q12791 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
KCNMA1Q12791 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
KCNMA1Q12791 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
KCNMA1Q12791 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
KCNMA1Q12791 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
KCNMA1Q12791 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
KCNMA1Q12791 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
KCNMA1Q12791 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
KCNMA1Q12791 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
KCNMA1Q12791 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
KCNMA1Q12791 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
KCNMA1Q12791 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
KCNMA1Q12791 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
KCNMA1Q12791 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
KCNMA1Q12791 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
KCNMA1Q12791 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
KCNMA1Q12791 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
KCNMA1Q12791 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
KCNMA1Q12791 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
KCNMA1Q12791 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
KCNMA1Q12791 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
KCNMA1Q12791 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
KCNMA1Q12791 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
KCNMA1Q12791 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
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