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Protein–RNA interactions for Protein: Q12455
SPE4, Spermine synthase, yeast
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Protein
RNA
Prediction (catRAPID)
Interaction (RIP-Chip)
Gene
UniProt Accession
Gene
Ensembl Transcript ID
Length
Transcript Status
Prediction Score
Prediction z-Score
Detected Interaction
SPE4
Q12455
VPS15
YBR097W
4365 nt
1.6
□□□□□ -2.15
SPE4
Q12455
RAD50
YNL250W
3939 nt
1.59
□□□□□ -2.15
SPE4
Q12455
BPH1
YCR032W
6504 nt
1.59
□□□□□ -2.15
SPE4
Q12455
TAR1
YLR154W-C
375 nt
1.59
□□□□□ -2.15
SPE4
Q12455
YOL160W
YOL160W
342 nt
1.59
□□□□□ -2.15
SPE4
Q12455
YLL054C
YLL054C
2532 nt
1.58
□□□□□ -2.16
SPE4
Q12455
YJL135W
YJL135W
318 nt
1.58
□□□□□ -2.16
SPE4
Q12455
YMR290W-A
YMR290W-A
348 nt
1.58
□□□□□ -2.16
SPE4
Q12455
YPL225W
YPL225W
441 nt
1.58
□□□□□ -2.16
SPE4
Q12455
snR36
snR36
182 nt
1.58
□□□□□ -2.16
SPE4
Q12455
MVP1
YMR004W
1536 nt
1.57
□□□□□ -2.16
SPE4
Q12455
NCA2
YPR155C
1851 nt
1.57
□□□□□ -2.16
SPE4
Q12455
YMR247W-A
YMR247W-A
144 nt
1.57
□□□□□ -2.16
SPE4
Q12455
SPO24
YPR036W-A
204 nt
1.57
□□□□□ -2.16
SPE4
Q12455
UFD2
YDL190C
2886 nt
1.57
□□□□□ -2.16
SPE4
Q12455
ENV11
YGR071C
2583 nt
1.57
□□□□□ -2.16
SPE4
Q12455
NUP192
YJL039C
5052 nt
1.57
□□□□□ -2.16
SPE4
Q12455
YMR175W-A
YMR175W-A
195 nt
1.56
□□□□□ -2.16
SPE4
Q12455
COA6
YMR244C-A
315 nt
1.56
□□□□□ -2.16
SPE4
Q12455
YOR376W
YOR376W
369 nt
1.56
□□□□□ -2.16
SPE4
Q12455
MAD1
YGL086W
2250 nt
1.55
□□□□□ -2.16
SPE4
Q12455
BST1
YFL025C
3090 nt
1.55
□□□□□ -2.16
SPE4
Q12455
YDR048C
YDR048C
315 nt
1.55
□□□□□ -2.16
SPE4
Q12455
YDR182W-A
YDR182W-A
204 nt
1.55
□□□□□ -2.16
SPE4
Q12455
COF1
YLL050C
432 nt
1.55
□□□□□ -2.16
SPE4
Q12455
YLR140W
YLR140W
327 nt
1.55
□□□□□ -2.16
SPE4
Q12455
YAR029W
YAR029W
225 nt
1.55
□□□□□ -2.16
SPE4
Q12455
YMR230W-A
YMR230W-A
189 nt
1.55
□□□□□ -2.16
SPE4
Q12455
YSY6
YBR162W-A
198 nt
1.55
□□□□□ -2.16
SPE4
Q12455
SMC4
YLR086W
4257 nt
1.54
□□□□□ -2.16
SPE4
Q12455
YLR035C-A
YLR035C-A
3468 nt
1.54
□□□□□ -2.16
SPE4
Q12455
TBS1
YBR150C
3285 nt
1.54
□□□□□ -2.16
SPE4
Q12455
YDR413C
YDR413C
576 nt
1.54
□□□□□ -2.16
SPE4
Q12455
MON2
YNL297C
4911 nt
1.54
□□□□□ -2.16
SPE4
Q12455
VPS54
YDR027C
2670 nt
1.53
□□□□□ -2.16
SPE4
Q12455
YDR183C-A
YDR183C-A
258 nt
1.53
□□□□□ -2.16
SPE4
Q12455
SCW11
YGL028C
1629 nt
1.53
□□□□□ -2.16
SPE4
Q12455
YJL022W
YJL022W
309 nt
1.53
□□□□□ -2.16
SPE4
Q12455
AIM44
YPL158C
2277 nt
1.53
□□□□□ -2.16
SPE4
Q12455
SXM1
YDR395W
2835 nt
1.53
□□□□□ -2.17
SPE4
Q12455
NHP2
YDL208W
471 nt
1.52
□□□□□ -2.17
SPE4
Q12455
YFL032W
YFL032W
321 nt
1.52
□□□□□ -2.17
SPE4
Q12455
YGL217C
YGL217C
342 nt
1.52
□□□□□ -2.17
SPE4
Q12455
RPL39
YJL189W
156 nt
1.52
□□□□□ -2.17
SPE4
Q12455
SLI15
YBR156C
2097 nt
1.52
□□□□□ -2.17
SPE4
Q12455
BRR2
YER172C
6492 nt
1.52
□□□□□ -2.17
SPE4
Q12455
TRM3
YDL112W
4311 nt
1.52
□□□□□ -2.17
SPE4
Q12455
SLX4
YLR135W
2247 nt
1.51
□□□□□ -2.17
SPE4
Q12455
CCH1
YGR217W
6120 nt
1.51
□□□□□ -2.17
SPE4
Q12455
YDL211C
YDL211C
1119 nt
1.51
□□□□□ -2.17
SPE4
Q12455
YGL149W
YGL149W
306 nt
1.51
□□□□□ -2.17
SPE4
Q12455
YIR044C
YIR044C
186 nt
1.51
□□□□□ -2.17
SPE4
Q12455
ALK1
YGL021W
2283 nt
1.51
□□□□□ -2.17
SPE4
Q12455
CUL3
YGR003W
2235 nt
1.51
□□□□□ -2.17
SPE4
Q12455
RAD34
YDR314C
2079 nt
1.51
□□□□□ -2.17
SPE4
Q12455
MAM33
YIL070C
801 nt
1.5
□□□□□ -2.17
SPE4
Q12455
YBR174C
YBR174C
315 nt
1.5
□□□□□ -2.17
SPE4
Q12455
CAT8
YMR280C
4302 nt
1.49
□□□□□ -2.17
SPE4
Q12455
tQ(UUG)E2
tQ(UUG)E2
72 nt
1.49
□□□□□ -2.17
SPE4
Q12455
YIL102C
YIL102C
306 nt
1.49
□□□□□ -2.17
SPE4
Q12455
OST1
YJL002C
1431 nt
1.49
□□□□□ -2.17
SPE4
Q12455
PMD1
YER132C
5262 nt
1.48
□□□□□ -2.17
SPE4
Q12455
KCS1
YDR017C
3153 nt
1.48
□□□□□ -2.17
SPE4
Q12455
YER097W
YER097W
330 nt
1.48
□□□□□ -2.17
SPE4
Q12455
VPS55
YJR044C
423 nt
1.48
□□□□□ -2.17
SPE4
Q12455
NUT1
YGL151W
3399 nt
1.47
□□□□□ -2.17
SPE4
Q12455
YMR031W-A
YMR031W-A
327 nt
1.47
□□□□□ -2.17
SPE4
Q12455
YNL146W
YNL146W
303 nt
1.47
□□□□□ -2.17
SPE4
Q12455
MPT5
YGL178W
2580 nt
1.46
□□□□□ -2.18
SPE4
Q12455
COG4
YPR105C
2586 nt
1.46
□□□□□ -2.18
SPE4
Q12455
HTL1
YCR020W-B
237 nt
1.46
□□□□□ -2.18
SPE4
Q12455
YJL015C
YJL015C
285 nt
1.46
□□□□□ -2.18
SPE4
Q12455
PFD1
YJL179W
330 nt
1.46
□□□□□ -2.18
SPE4
Q12455
YOR161W-B
YOR161W-B
261 nt
1.46
□□□□□ -2.18
SPE4
Q12455
PTP2
YOR208W
2253 nt
1.46
□□□□□ -2.18
SPE4
Q12455
NIP100
YPL174C
2607 nt
1.46
□□□□□ -2.18
SPE4
Q12455
LCD1
YDR499W
2244 nt
1.46
□□□□□ -2.18
SPE4
Q12455
PKH2
YOL100W
3246 nt
1.45
□□□□□ -2.18
SPE4
Q12455
STE5
YDR103W
2754 nt
1.45
□□□□□ -2.18
SPE4
Q12455
CHS1
YNL192W
3396 nt
1.45
□□□□□ -2.18
SPE4
Q12455
AZF1
YOR113W
2745 nt
1.45
□□□□□ -2.18
SPE4
Q12455
YFL063W
YFL063W
456 nt
1.45
□□□□□ -2.18
SPE4
Q12455
YPR063C
YPR063C
423 nt
1.45
□□□□□ -2.18
SPE4
Q12455
DBP6
YNR038W
1890 nt
1.45
□□□□□ -2.18
SPE4
Q12455
ADR1
YDR216W
3972 nt
1.45
□□□□□ -2.18
SPE4
Q12455
SPC98
YNL126W
2541 nt
1.44
□□□□□ -2.18
SPE4
Q12455
SSK2
YNR031C
4740 nt
1.44
□□□□□ -2.18
SPE4
Q12455
MMS4
YBR098W
2076 nt
1.44
□□□□□ -2.18
SPE4
Q12455
PET127
YOR017W
2403 nt
1.44
□□□□□ -2.18
SPE4
Q12455
KAP122
YGL016W
3246 nt
1.43
□□□□□ -2.18
SPE4
Q12455
RPL34B
YIL052C
366 nt
1.43
□□□□□ -2.18
SPE4
Q12455
YMR193C-A
YMR193C-A
387 nt
1.43
□□□□□ -2.18
SPE4
Q12455
SPT21
YMR179W
2277 nt
1.43
□□□□□ -2.18
SPE4
Q12455
EST2
YLR318W
2655 nt
1.43
□□□□□ -2.18
SPE4
Q12455
HMRA2
YCR096C
360 nt
1.42
□□□□□ -2.18
SPE4
Q12455
GPG1
YGL121C
381 nt
1.42
□□□□□ -2.18
SPE4
Q12455
PBY1
YBR094W
2262 nt
1.42
□□□□□ -2.18
SPE4
Q12455
PIP2
YOR363C
2991 nt
1.41
□□□□□ -2.18
SPE4
Q12455
MSH3
YCR092C
3057 nt
1.41
□□□□□ -2.18
SPE4
Q12455
YLL007C
YLL007C
1998 nt
1.41
□□□□□ -2.18
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