Protein–RNA interactions for Protein: Q12189

RKI1, Ribose-5-phosphate isomerase, yeastyeast

Predictions only

Length 258 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RKI1Q12189 YHR180W-AYHR180W-A 183 nt2.02□□□□□ -2.09
RKI1Q12189 tW(CCA)G1tW(CCA)G1 72 nt2.02□□□□□ -2.09
RKI1Q12189 RPL34BYIL052C 366 nt2.02□□□□□ -2.09
RKI1Q12189 tW(CCA)G2tW(CCA)G2 72 nt2.02□□□□□ -2.09
RKI1Q12189 tW(CCA)JtW(CCA)J 72 nt2.02□□□□□ -2.09
RKI1Q12189 tW(CCA)KtW(CCA)K 72 nt2.02□□□□□ -2.09
RKI1Q12189 tW(CCA)MtW(CCA)M 72 nt2.02□□□□□ -2.09
RKI1Q12189 tW(CCA)PtW(CCA)P 72 nt2.02□□□□□ -2.09
RKI1Q12189 YBR131C-AYBR131C-A 90 nt2.02□□□□□ -2.09
RKI1Q12189 TRL1YJL087C 2484 nt2.02□□□□□ -2.09
RKI1Q12189 HSH155YMR288W 2916 nt2.02□□□□□ -2.09
RKI1Q12189 MCM10YIL150C 1716 nt2.02□□□□□ -2.09
RKI1Q12189 RLM1YPL089C 2031 nt2.01□□□□□ -2.09
RKI1Q12189 PUT3YKL015W 2940 nt2.01□□□□□ -2.09
RKI1Q12189 ZIP2YGL249W 2115 nt2.01□□□□□ -2.09
RKI1Q12189 YNL097C-BYNL097C-B 123 nt2.01□□□□□ -2.09
RKI1Q12189 YHR032W-AYHR032W-A 180 nt2□□□□□ -2.09
RKI1Q12189 ATP7YKL016C 525 nt2□□□□□ -2.09
RKI1Q12189 MAK10YEL053C 2202 nt2□□□□□ -2.09
RKI1Q12189 STH1YIL126W 4080 nt2□□□□□ -2.09
RKI1Q12189 SAS3YBL052C 2496 nt2□□□□□ -2.09
RKI1Q12189 SPO21YOL091W 1830 nt2□□□□□ -2.09
RKI1Q12189 PDR11YIL013C 4236 nt2□□□□□ -2.09
RKI1Q12189 CDC60YPL160W 3273 nt2□□□□□ -2.09
RKI1Q12189 ENV11YGR071C 2583 nt1.99□□□□□ -2.09
RKI1Q12189 snR70snR70 164 nt1.99□□□□□ -2.09
RKI1Q12189 YKR075W-AYKR075W-A 270 nt1.99□□□□□ -2.09
RKI1Q12189 YOR108C-AYOR108C-A 210 nt1.99□□□□□ -2.09
RKI1Q12189 VPS13YLL040C 9435 nt1.99□□□□□ -2.09
RKI1Q12189 CAT2YML042W 2013 nt1.99□□□□□ -2.09
RKI1Q12189 SVL3YPL032C 2478 nt1.99□□□□□ -2.09
RKI1Q12189 TUS1YLR425W 3924 nt1.99□□□□□ -2.09
RKI1Q12189 BNI1YNL271C 5862 nt1.99□□□□□ -2.09
RKI1Q12189 NAM7YMR080C 2916 nt1.99□□□□□ -2.09
RKI1Q12189 SYH1YPL105C 2550 nt1.99□□□□□ -2.09
RKI1Q12189 RAD34YDR314C 2079 nt1.98□□□□□ -2.09
RKI1Q12189 YDR182W-AYDR182W-A 204 nt1.98□□□□□ -2.09
RKI1Q12189 BRP1YGL007W 378 nt1.98□□□□□ -2.09
RKI1Q12189 ECM12YHR021W-A 456 nt1.98□□□□□ -2.09
RKI1Q12189 YOR055WYOR055W 435 nt1.98□□□□□ -2.09
RKI1Q12189 TOR2YKL203C 7425 nt1.98□□□□□ -2.09
RKI1Q12189 ELG1YOR144C 2376 nt1.98□□□□□ -2.09
RKI1Q12189 RTT107YHR154W 3213 nt1.97□□□□□ -2.09
RKI1Q12189 ATG11YPR049C 3537 nt1.97□□□□□ -2.09
RKI1Q12189 RPL37BYDR500C 267 nt1.97□□□□□ -2.09
RKI1Q12189 ULI1YFR026C 510 nt1.97□□□□□ -2.09
RKI1Q12189 YJL120WYJL120W 324 nt1.97□□□□□ -2.09
RKI1Q12189 RPS25BYLR333C 327 nt1.97□□□□□ -2.09
RKI1Q12189 YOR170WYOR170W 306 nt1.97□□□□□ -2.09
RKI1Q12189 MSH5YDL154W 2706 nt1.97□□□□□ -2.09
RKI1Q12189 SCD5YOR329C 2619 nt1.97□□□□□ -2.09
RKI1Q12189 SLN1YIL147C 3663 nt1.96□□□□□ -2.1
RKI1Q12189 YBR174CYBR174C 315 nt1.96□□□□□ -2.1
RKI1Q12189 snR52snR52 92 nt1.96□□□□□ -2.1
RKI1Q12189 APL2YKL135C 2181 nt1.96□□□□□ -2.1
RKI1Q12189 NOC3YLR002C 1992 nt1.96□□□□□ -2.1
RKI1Q12189 MAD1YGL086W 2250 nt1.96□□□□□ -2.1
RKI1Q12189 UBP1YDL122W 2430 nt1.96□□□□□ -2.1
RKI1Q12189 SEC16YPL085W 6588 nt1.95□□□□□ -2.1
RKI1Q12189 PET309YLR067C 2898 nt1.95□□□□□ -2.1
RKI1Q12189 YOR072W-BYOR072W-B 162 nt1.95□□□□□ -2.1
RKI1Q12189 MLH3YPL164C 2148 nt1.95□□□□□ -2.1
RKI1Q12189 snR46snR46 197 nt1.95□□□□□ -2.1
RKI1Q12189 RGA1YOR127W 3024 nt1.95□□□□□ -2.1
RKI1Q12189 PHO91YNR013C 2685 nt1.94□□□□□ -2.1
RKI1Q12189 RPL31AYDL075W 342 nt1.94□□□□□ -2.1
RKI1Q12189 VTC1YER072W 390 nt1.94□□□□□ -2.1
RKI1Q12189 NUP170YBL079W 4509 nt1.94□□□□□ -2.1
RKI1Q12189 RTT101YJL047C 2529 nt1.93□□□□□ -2.1
RKI1Q12189 UBR2YLR024C 5619 nt1.93□□□□□ -2.1
RKI1Q12189 YIL156W-BYIL156W-B 222 nt1.93□□□□□ -2.1
RKI1Q12189 COF1YLL050C 432 nt1.93□□□□□ -2.1
RKI1Q12189 YPR097WYPR097W 3222 nt1.93□□□□□ -2.1
RKI1Q12189 YCR087C-AYCR087C-A 462 nt1.92□□□□□ -2.1
RKI1Q12189 YNL170WYNL170W 396 nt1.92□□□□□ -2.1
RKI1Q12189 CTR9YOL145C 3234 nt1.92□□□□□ -2.1
RKI1Q12189 YHR214C-BYHR214C-B 5382 nt1.91□□□□□ -2.1
RKI1Q12189 AGC1YPR021C 2709 nt1.91□□□□□ -2.1
RKI1Q12189 KOG1YHR186C 4674 nt1.91□□□□□ -2.1
RKI1Q12189 SSD1YDR293C 3753 nt1.91□□□□□ -2.1
RKI1Q12189 STE11YLR362W 2154 nt1.91□□□□□ -2.1
RKI1Q12189 MSB1YOR188W 3414 nt1.91□□□□□ -2.1
RKI1Q12189 HMI1YOL095C 2121 nt1.91□□□□□ -2.1
RKI1Q12189 YOL098CYOL098C 3114 nt1.91□□□□□ -2.1
RKI1Q12189 YLL007CYLL007C 1998 nt1.9□□□□□ -2.1
RKI1Q12189 DGR2YKL121W 2559 nt1.9□□□□□ -2.11
RKI1Q12189 PIG1YLR273C 1947 nt1.9□□□□□ -2.11
RKI1Q12189 YIR044CYIR044C 186 nt1.9□□□□□ -2.11
RKI1Q12189 USO1YDL058W 5373 nt1.9□□□□□ -2.11
RKI1Q12189 LRE1YCL051W 1752 nt1.9□□□□□ -2.11
RKI1Q12189 IRE1YHR079C 3348 nt1.89□□□□□ -2.11
RKI1Q12189 YOR345CYOR345C 351 nt1.89□□□□□ -2.11
RKI1Q12189 HIR3YJR140C 4947 nt1.88□□□□□ -2.11
RKI1Q12189 PAU3YCR104W 375 nt1.88□□□□□ -2.11
RKI1Q12189 YLL019W-AYLL019W-A 93 nt1.88□□□□□ -2.11
RKI1Q12189 CUL3YGR003W 2235 nt1.88□□□□□ -2.11
RKI1Q12189 BUD2YKL092C 3315 nt1.88□□□□□ -2.11
RKI1Q12189 HSL1YKL101W 4557 nt1.88□□□□□ -2.11
RKI1Q12189 YFR016CYFR016C 3702 nt1.88□□□□□ -2.11
RKI1Q12189 IST2YBR086C 2841 nt1.87□□□□□ -2.11
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