Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2K0

NIPAL4, Magnesium transporter NIPA4, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPAL4Q0D2K0 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NIPAL4Q0D2K0 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
NIPAL4Q0D2K0 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NIPAL4Q0D2K0 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
NIPAL4Q0D2K0 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NIPAL4Q0D2K0 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NIPAL4Q0D2K0 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NIPAL4Q0D2K0 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NIPAL4Q0D2K0 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NIPAL4Q0D2K0 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NIPAL4Q0D2K0 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NIPAL4Q0D2K0 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NIPAL4Q0D2K0 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NIPAL4Q0D2K0 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NIPAL4Q0D2K0 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NIPAL4Q0D2K0 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NIPAL4Q0D2K0 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NIPAL4Q0D2K0 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NIPAL4Q0D2K0 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NIPAL4Q0D2K0 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NIPAL4Q0D2K0 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NIPAL4Q0D2K0 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NIPAL4Q0D2K0 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NIPAL4Q0D2K0 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NIPAL4Q0D2K0 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NIPAL4Q0D2K0 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NIPAL4Q0D2K0 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
NIPAL4Q0D2K0 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NIPAL4Q0D2K0 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NIPAL4Q0D2K0 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
NIPAL4Q0D2K0 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NIPAL4Q0D2K0 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NIPAL4Q0D2K0 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NIPAL4Q0D2K0 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NIPAL4Q0D2K0 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NIPAL4Q0D2K0 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NIPAL4Q0D2K0 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NIPAL4Q0D2K0 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NIPAL4Q0D2K0 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NIPAL4Q0D2K0 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NIPAL4Q0D2K0 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NIPAL4Q0D2K0 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NIPAL4Q0D2K0 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NIPAL4Q0D2K0 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NIPAL4Q0D2K0 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NIPAL4Q0D2K0 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
NIPAL4Q0D2K0 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NIPAL4Q0D2K0 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NIPAL4Q0D2K0 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
NIPAL4Q0D2K0 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NIPAL4Q0D2K0 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NIPAL4Q0D2K0 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NIPAL4Q0D2K0 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NIPAL4Q0D2K0 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NIPAL4Q0D2K0 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NIPAL4Q0D2K0 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NIPAL4Q0D2K0 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NIPAL4Q0D2K0 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NIPAL4Q0D2K0 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NIPAL4Q0D2K0 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NIPAL4Q0D2K0 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NIPAL4Q0D2K0 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NIPAL4Q0D2K0 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NIPAL4Q0D2K0 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NIPAL4Q0D2K0 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NIPAL4Q0D2K0 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
NIPAL4Q0D2K0 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
NIPAL4Q0D2K0 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
NIPAL4Q0D2K0 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NIPAL4Q0D2K0 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NIPAL4Q0D2K0 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NIPAL4Q0D2K0 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NIPAL4Q0D2K0 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NIPAL4Q0D2K0 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NIPAL4Q0D2K0 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NIPAL4Q0D2K0 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NIPAL4Q0D2K0 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NIPAL4Q0D2K0 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NIPAL4Q0D2K0 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
NIPAL4Q0D2K0 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NIPAL4Q0D2K0 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NIPAL4Q0D2K0 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
NIPAL4Q0D2K0 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NIPAL4Q0D2K0 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NIPAL4Q0D2K0 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NIPAL4Q0D2K0 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NIPAL4Q0D2K0 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NIPAL4Q0D2K0 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NIPAL4Q0D2K0 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NIPAL4Q0D2K0 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NIPAL4Q0D2K0 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NIPAL4Q0D2K0 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NIPAL4Q0D2K0 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NIPAL4Q0D2K0 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NIPAL4Q0D2K0 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NIPAL4Q0D2K0 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NIPAL4Q0D2K0 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NIPAL4Q0D2K0 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NIPAL4Q0D2K0 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NIPAL4Q0D2K0 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms