Protein–RNA interactions for Protein: Q08722

CD47, Leukocyte surface antigen CD47, humanhuman

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD47Q08722 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CD47Q08722 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CD47Q08722 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CD47Q08722 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CD47Q08722 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CD47Q08722 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CD47Q08722 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CD47Q08722 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CD47Q08722 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CD47Q08722 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CD47Q08722 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CD47Q08722 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
CD47Q08722 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CD47Q08722 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CD47Q08722 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CD47Q08722 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CD47Q08722 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CD47Q08722 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CD47Q08722 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CD47Q08722 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CD47Q08722 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
CD47Q08722 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
CD47Q08722 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CD47Q08722 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CD47Q08722 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CD47Q08722 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CD47Q08722 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CD47Q08722 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CD47Q08722 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CD47Q08722 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CD47Q08722 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CD47Q08722 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CD47Q08722 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CD47Q08722 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CD47Q08722 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CD47Q08722 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CD47Q08722 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CD47Q08722 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CD47Q08722 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CD47Q08722 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CD47Q08722 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CD47Q08722 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CD47Q08722 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CD47Q08722 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
CD47Q08722 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CD47Q08722 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CD47Q08722 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CD47Q08722 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CD47Q08722 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CD47Q08722 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CD47Q08722 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CD47Q08722 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CD47Q08722 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CD47Q08722 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CD47Q08722 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CD47Q08722 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CD47Q08722 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CD47Q08722 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CD47Q08722 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CD47Q08722 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CD47Q08722 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CD47Q08722 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CD47Q08722 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CD47Q08722 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CD47Q08722 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CD47Q08722 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CD47Q08722 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CD47Q08722 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CD47Q08722 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CD47Q08722 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CD47Q08722 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CD47Q08722 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CD47Q08722 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
CD47Q08722 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CD47Q08722 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CD47Q08722 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CD47Q08722 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CD47Q08722 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CD47Q08722 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CD47Q08722 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CD47Q08722 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CD47Q08722 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CD47Q08722 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CD47Q08722 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CD47Q08722 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CD47Q08722 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CD47Q08722 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CD47Q08722 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CD47Q08722 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CD47Q08722 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CD47Q08722 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CD47Q08722 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CD47Q08722 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CD47Q08722 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CD47Q08722 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CD47Q08722 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CD47Q08722 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CD47Q08722 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CD47Q08722 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CD47Q08722 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms