Protein–RNA interactions for Protein: Q08490

SGO1, Shugoshin, yeastyeast

Predictions only

Length 590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SGO1Q08490 EMP24YGL200C 612 nt2.3□□□□□ -2.04
SGO1Q08490 PAU8YAL068C 363 nt2.3□□□□□ -2.04
SGO1Q08490 PAU20YOL161C 363 nt2.3□□□□□ -2.04
SGO1Q08490 SGF11YPL047W 300 nt2.3□□□□□ -2.04
SGO1Q08490 snR46snR46 197 nt2.3□□□□□ -2.04
SGO1Q08490 snR52snR52 92 nt2.3□□□□□ -2.04
SGO1Q08490 SAP190YKR028W 3102 nt2.3□□□□□ -2.04
SGO1Q08490 IRC8YJL051W 2469 nt2.29□□□□□ -2.04
SGO1Q08490 RFX1YLR176C 2436 nt2.29□□□□□ -2.04
SGO1Q08490 MNE1YOR350C 1992 nt2.29□□□□□ -2.04
SGO1Q08490 YHR073W-AYHR073W-A 177 nt2.29□□□□□ -2.04
SGO1Q08490 SWI5YDR146C 2130 nt2.29□□□□□ -2.04
SGO1Q08490 DNF1YER166W 4716 nt2.29□□□□□ -2.04
SGO1Q08490 UBR1YGR184C 5853 nt2.29□□□□□ -2.04
SGO1Q08490 CLN3YAL040C 1743 nt2.28□□□□□ -2.04
SGO1Q08490 YGR164WYGR164W 336 nt2.28□□□□□ -2.04
SGO1Q08490 NIP100YPL174C 2607 nt2.28□□□□□ -2.04
SGO1Q08490 LRE1YCL051W 1752 nt2.28□□□□□ -2.04
SGO1Q08490 YHR180W-AYHR180W-A 183 nt2.27□□□□□ -2.05
SGO1Q08490 PAU18YLL064C 363 nt2.27□□□□□ -2.05
SGO1Q08490 RPS17AYML024W 411 nt2.27□□□□□ -2.05
SGO1Q08490 PAU6YNR076W 363 nt2.27□□□□□ -2.05
SGO1Q08490 RGA1YOR127W 3024 nt2.26□□□□□ -2.05
SGO1Q08490 RPS27BYHR021C 249 nt2.26□□□□□ -2.05
SGO1Q08490 LYS14YDR034C 2373 nt2.25□□□□□ -2.05
SGO1Q08490 snR85snR85 171 nt2.25□□□□□ -2.05
SGO1Q08490 YIL020C-AYIL020C-A 339 nt2.25□□□□□ -2.05
SGO1Q08490 COF1YLL050C 432 nt2.25□□□□□ -2.05
SGO1Q08490 YOR218CYOR218C 420 nt2.25□□□□□ -2.05
SGO1Q08490 SPC98YNL126W 2541 nt2.25□□□□□ -2.05
SGO1Q08490 YHR071C-AYHR071C-A 321 nt2.24□□□□□ -2.05
SGO1Q08490 snR48snR48 113 nt2.24□□□□□ -2.05
SGO1Q08490 RTT107YHR154W 3213 nt2.24□□□□□ -2.05
SGO1Q08490 YPR097WYPR097W 3222 nt2.24□□□□□ -2.05
SGO1Q08490 SIR4YDR227W 4077 nt2.24□□□□□ -2.05
SGO1Q08490 ULI1YFR026C 510 nt2.23□□□□□ -2.05
SGO1Q08490 YCL046WYCL046W 324 nt2.23□□□□□ -2.05
SGO1Q08490 SLY1YDR189W 2001 nt2.23□□□□□ -2.05
SGO1Q08490 UTP22YGR090W 3714 nt2.22□□□□□ -2.05
SGO1Q08490 YOR381W-AYOR381W-A 168 nt2.22□□□□□ -2.05
SGO1Q08490 SPO75YLL005C 2607 nt2.22□□□□□ -2.05
SGO1Q08490 SRP14YDL092W 441 nt2.21□□□□□ -2.06
SGO1Q08490 ECM12YHR021W-A 456 nt2.21□□□□□ -2.06
SGO1Q08490 YBL012CYBL012C 402 nt2.21□□□□□ -2.06
SGO1Q08490 TDA9YML081W 3756 nt2.21□□□□□ -2.06
SGO1Q08490 NOP14YDL148C 2433 nt2.21□□□□□ -2.06
SGO1Q08490 INO80YGL150C 4470 nt2.21□□□□□ -2.06
SGO1Q08490 ZRG17YNR039C 1818 nt2.21□□□□□ -2.06
SGO1Q08490 SSD1YDR293C 3753 nt2.21□□□□□ -2.06
SGO1Q08490 MCM10YIL150C 1716 nt2.2□□□□□ -2.06
SGO1Q08490 BNI1YNL271C 5862 nt2.2□□□□□ -2.06
SGO1Q08490 CUL3YGR003W 2235 nt2.19□□□□□ -2.06
SGO1Q08490 SPO21YOL091W 1830 nt2.19□□□□□ -2.06
SGO1Q08490 YOR345CYOR345C 351 nt2.19□□□□□ -2.06
SGO1Q08490 GYP5YPL249C 2685 nt2.19□□□□□ -2.06
SGO1Q08490 ENV11YGR071C 2583 nt2.18□□□□□ -2.06
SGO1Q08490 YCR102W-AYCR102W-A 198 nt2.18□□□□□ -2.06
SGO1Q08490 YDR003W-AYDR003W-A 123 nt2.18□□□□□ -2.06
SGO1Q08490 YDR182W-AYDR182W-A 204 nt2.18□□□□□ -2.06
SGO1Q08490 STH1YIL126W 4080 nt2.18□□□□□ -2.06
SGO1Q08490 MSC6YOR354C 2079 nt2.18□□□□□ -2.06
SGO1Q08490 HSH155YMR288W 2916 nt2.17□□□□□ -2.06
SGO1Q08490 YBL053WYBL053W 375 nt2.17□□□□□ -2.06
SGO1Q08490 UBP2YOR124C 3819 nt2.17□□□□□ -2.06
SGO1Q08490 SAP185YJL098W 3177 nt2.17□□□□□ -2.06
SGO1Q08490 SEC16YPL085W 6588 nt2.16□□□□□ -2.06
SGO1Q08490 PMP1YCR024C-A 123 nt2.16□□□□□ -2.06
SGO1Q08490 TRL1YJL087C 2484 nt2.15□□□□□ -2.06
SGO1Q08490 ELG1YOR144C 2376 nt2.15□□□□□ -2.06
SGO1Q08490 EDS1YBR033W 2760 nt2.15□□□□□ -2.07
SGO1Q08490 RPL34BYIL052C 366 nt2.15□□□□□ -2.07
SGO1Q08490 RPL33BYOR234C 324 nt2.15□□□□□ -2.07
SGO1Q08490 YBR174CYBR174C 315 nt2.15□□□□□ -2.07
SGO1Q08490 TFC8YPL007C 1767 nt2.15□□□□□ -2.07
SGO1Q08490 YDR341CYDR341C 1824 nt2.14□□□□□ -2.07
SGO1Q08490 TIM9YEL020W-A 264 nt2.14□□□□□ -2.07
SGO1Q08490 YJL120WYJL120W 324 nt2.14□□□□□ -2.07
SGO1Q08490 RPS25BYLR333C 327 nt2.14□□□□□ -2.07
SGO1Q08490 YOR072W-BYOR072W-B 162 nt2.14□□□□□ -2.07
SGO1Q08490 YOR161W-BYOR161W-B 261 nt2.14□□□□□ -2.07
SGO1Q08490 MSH5YDL154W 2706 nt2.14□□□□□ -2.07
SGO1Q08490 RLM1YPL089C 2031 nt2.13□□□□□ -2.07
SGO1Q08490 SPP41YDR464W 4308 nt2.13□□□□□ -2.07
SGO1Q08490 RAV1YJR033C 4074 nt2.13□□□□□ -2.07
SGO1Q08490 TFC3YAL001C 3483 nt2.13□□□□□ -2.07
SGO1Q08490 GIP3YPL137C 3831 nt2.13□□□□□ -2.07
SGO1Q08490 SYH1YPL105C 2550 nt2.13□□□□□ -2.07
SGO1Q08490 CAT2YML042W 2013 nt2.13□□□□□ -2.07
SGO1Q08490 TOR2YKL203C 7425 nt2.13□□□□□ -2.07
SGO1Q08490 YOR343W-BYOR343W-B 5313 nt2.12□□□□□ -2.07
SGO1Q08490 CHC1YGL206C 4962 nt2.12□□□□□ -2.07
SGO1Q08490 YKR075W-AYKR075W-A 270 nt2.12□□□□□ -2.07
SGO1Q08490 NAM7YMR080C 2916 nt2.12□□□□□ -2.07
SGO1Q08490 YMR242W-AYMR242W-A 90 nt2.11□□□□□ -2.07
SGO1Q08490 DGR1YNL130C-A 147 nt2.11□□□□□ -2.07
SGO1Q08490 PRP42YDR235W 1635 nt2.1□□□□□ -2.07
SGO1Q08490 NEO1YIL048W 3456 nt2.1□□□□□ -2.07
SGO1Q08490 RAD34YDR314C 2079 nt2.1□□□□□ -2.07
SGO1Q08490 AGC1YPR021C 2709 nt2.1□□□□□ -2.07
SGO1Q08490 RPL31AYDL075W 342 nt2.1□□□□□ -2.07
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 14.1 ms