Protein–RNA interactions for Protein: Q08188

TGM3, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase E, humanhuman

Predictions only

Length 693 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGM3Q08188 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TGM3Q08188 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
TGM3Q08188 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
TGM3Q08188 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TGM3Q08188 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TGM3Q08188 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TGM3Q08188 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TGM3Q08188 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TGM3Q08188 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TGM3Q08188 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TGM3Q08188 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TGM3Q08188 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TGM3Q08188 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TGM3Q08188 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TGM3Q08188 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TGM3Q08188 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TGM3Q08188 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TGM3Q08188 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TGM3Q08188 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TGM3Q08188 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TGM3Q08188 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TGM3Q08188 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TGM3Q08188 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TGM3Q08188 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TGM3Q08188 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TGM3Q08188 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TGM3Q08188 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
TGM3Q08188 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TGM3Q08188 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
TGM3Q08188 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TGM3Q08188 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TGM3Q08188 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TGM3Q08188 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TGM3Q08188 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
TGM3Q08188 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TGM3Q08188 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TGM3Q08188 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TGM3Q08188 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TGM3Q08188 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
TGM3Q08188 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TGM3Q08188 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TGM3Q08188 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TGM3Q08188 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TGM3Q08188 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TGM3Q08188 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TGM3Q08188 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
TGM3Q08188 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TGM3Q08188 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TGM3Q08188 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TGM3Q08188 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TGM3Q08188 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TGM3Q08188 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TGM3Q08188 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
TGM3Q08188 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
TGM3Q08188 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TGM3Q08188 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TGM3Q08188 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TGM3Q08188 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TGM3Q08188 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TGM3Q08188 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TGM3Q08188 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TGM3Q08188 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TGM3Q08188 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TGM3Q08188 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TGM3Q08188 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TGM3Q08188 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TGM3Q08188 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TGM3Q08188 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TGM3Q08188 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TGM3Q08188 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TGM3Q08188 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TGM3Q08188 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TGM3Q08188 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TGM3Q08188 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TGM3Q08188 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TGM3Q08188 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TGM3Q08188 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TGM3Q08188 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TGM3Q08188 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TGM3Q08188 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TGM3Q08188 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TGM3Q08188 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TGM3Q08188 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TGM3Q08188 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TGM3Q08188 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TGM3Q08188 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TGM3Q08188 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TGM3Q08188 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TGM3Q08188 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TGM3Q08188 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TGM3Q08188 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TGM3Q08188 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TGM3Q08188 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TGM3Q08188 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TGM3Q08188 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TGM3Q08188 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TGM3Q08188 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TGM3Q08188 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TGM3Q08188 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TGM3Q08188 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms