Protein–RNA interactions for Protein: Q07864

POLE, DNA polymerase epsilon catalytic subunit A, humanhuman

Predictions only

Length 2,286 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLEQ07864 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
POLEQ07864 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
POLEQ07864 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
POLEQ07864 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
POLEQ07864 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
POLEQ07864 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
POLEQ07864 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
POLEQ07864 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
POLEQ07864 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
POLEQ07864 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
POLEQ07864 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
POLEQ07864 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
POLEQ07864 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
POLEQ07864 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
POLEQ07864 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
POLEQ07864 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
POLEQ07864 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
POLEQ07864 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
POLEQ07864 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
POLEQ07864 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
POLEQ07864 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
POLEQ07864 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
POLEQ07864 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
POLEQ07864 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
POLEQ07864 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
POLEQ07864 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
POLEQ07864 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
POLEQ07864 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
POLEQ07864 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
POLEQ07864 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
POLEQ07864 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
POLEQ07864 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
POLEQ07864 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
POLEQ07864 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
POLEQ07864 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
POLEQ07864 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
POLEQ07864 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
POLEQ07864 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
POLEQ07864 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
POLEQ07864 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
POLEQ07864 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
POLEQ07864 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
POLEQ07864 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
POLEQ07864 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
POLEQ07864 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
POLEQ07864 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
POLEQ07864 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
POLEQ07864 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
POLEQ07864 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
POLEQ07864 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
POLEQ07864 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
POLEQ07864 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
POLEQ07864 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC17.89■□□□□ 0.46
POLEQ07864 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC17.89■□□□□ 0.46
POLEQ07864 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
POLEQ07864 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.46
POLEQ07864 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
POLEQ07864 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
POLEQ07864 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
POLEQ07864 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
POLEQ07864 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
POLEQ07864 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
POLEQ07864 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
POLEQ07864 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
POLEQ07864 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
POLEQ07864 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
POLEQ07864 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
POLEQ07864 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
POLEQ07864 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
POLEQ07864 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
POLEQ07864 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
POLEQ07864 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
POLEQ07864 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
POLEQ07864 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
POLEQ07864 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
POLEQ07864 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
POLEQ07864 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
POLEQ07864 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
POLEQ07864 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
POLEQ07864 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
POLEQ07864 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
POLEQ07864 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
POLEQ07864 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
POLEQ07864 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
POLEQ07864 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
POLEQ07864 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
POLEQ07864 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
POLEQ07864 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
POLEQ07864 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
POLEQ07864 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
POLEQ07864 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
POLEQ07864 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
POLEQ07864 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
POLEQ07864 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
POLEQ07864 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
POLEQ07864 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
POLEQ07864 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
POLEQ07864 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
POLEQ07864 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
POLEQ07864 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms