Protein–RNA interactions for Protein: Q07654

TFF3, Trefoil factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 80 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFF3Q07654 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TFF3Q07654 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TFF3Q07654 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TFF3Q07654 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TFF3Q07654 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TFF3Q07654 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TFF3Q07654 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TFF3Q07654 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
TFF3Q07654 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TFF3Q07654 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TFF3Q07654 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TFF3Q07654 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TFF3Q07654 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TFF3Q07654 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TFF3Q07654 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TFF3Q07654 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TFF3Q07654 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TFF3Q07654 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TFF3Q07654 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TFF3Q07654 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TFF3Q07654 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TFF3Q07654 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TFF3Q07654 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
TFF3Q07654 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TFF3Q07654 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TFF3Q07654 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
TFF3Q07654 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TFF3Q07654 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TFF3Q07654 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TFF3Q07654 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TFF3Q07654 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TFF3Q07654 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TFF3Q07654 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TFF3Q07654 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TFF3Q07654 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TFF3Q07654 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TFF3Q07654 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TFF3Q07654 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TFF3Q07654 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TFF3Q07654 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TFF3Q07654 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TFF3Q07654 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TFF3Q07654 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TFF3Q07654 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TFF3Q07654 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TFF3Q07654 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TFF3Q07654 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
TFF3Q07654 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TFF3Q07654 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TFF3Q07654 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TFF3Q07654 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TFF3Q07654 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TFF3Q07654 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TFF3Q07654 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TFF3Q07654 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TFF3Q07654 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TFF3Q07654 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
TFF3Q07654 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TFF3Q07654 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TFF3Q07654 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TFF3Q07654 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TFF3Q07654 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TFF3Q07654 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TFF3Q07654 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TFF3Q07654 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TFF3Q07654 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TFF3Q07654 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TFF3Q07654 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TFF3Q07654 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TFF3Q07654 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TFF3Q07654 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TFF3Q07654 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TFF3Q07654 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TFF3Q07654 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TFF3Q07654 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TFF3Q07654 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TFF3Q07654 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
TFF3Q07654 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
TFF3Q07654 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TFF3Q07654 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TFF3Q07654 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TFF3Q07654 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TFF3Q07654 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TFF3Q07654 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TFF3Q07654 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TFF3Q07654 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TFF3Q07654 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TFF3Q07654 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TFF3Q07654 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TFF3Q07654 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TFF3Q07654 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TFF3Q07654 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TFF3Q07654 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
TFF3Q07654 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TFF3Q07654 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TFF3Q07654 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TFF3Q07654 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TFF3Q07654 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TFF3Q07654 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TFF3Q07654 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms