Protein–RNA interactions for Protein: Q06945

SOX4, Transcription factor SOX-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX4Q06945 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SOX4Q06945 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SOX4Q06945 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SOX4Q06945 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SOX4Q06945 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SOX4Q06945 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
SOX4Q06945 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SOX4Q06945 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SOX4Q06945 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SOX4Q06945 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SOX4Q06945 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SOX4Q06945 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SOX4Q06945 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
SOX4Q06945 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SOX4Q06945 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SOX4Q06945 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SOX4Q06945 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SOX4Q06945 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SOX4Q06945 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SOX4Q06945 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SOX4Q06945 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SOX4Q06945 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SOX4Q06945 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SOX4Q06945 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SOX4Q06945 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SOX4Q06945 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SOX4Q06945 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SOX4Q06945 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SOX4Q06945 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SOX4Q06945 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SOX4Q06945 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
SOX4Q06945 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SOX4Q06945 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SOX4Q06945 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SOX4Q06945 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SOX4Q06945 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SOX4Q06945 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SOX4Q06945 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SOX4Q06945 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SOX4Q06945 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SOX4Q06945 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SOX4Q06945 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SOX4Q06945 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SOX4Q06945 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SOX4Q06945 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SOX4Q06945 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
SOX4Q06945 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SOX4Q06945 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
SOX4Q06945 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SOX4Q06945 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SOX4Q06945 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SOX4Q06945 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SOX4Q06945 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SOX4Q06945 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
SOX4Q06945 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SOX4Q06945 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SOX4Q06945 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SOX4Q06945 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SOX4Q06945 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SOX4Q06945 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SOX4Q06945 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SOX4Q06945 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SOX4Q06945 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SOX4Q06945 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SOX4Q06945 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SOX4Q06945 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SOX4Q06945 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SOX4Q06945 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SOX4Q06945 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
SOX4Q06945 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
SOX4Q06945 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SOX4Q06945 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SOX4Q06945 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SOX4Q06945 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SOX4Q06945 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SOX4Q06945 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SOX4Q06945 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SOX4Q06945 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SOX4Q06945 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SOX4Q06945 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SOX4Q06945 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SOX4Q06945 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SOX4Q06945 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SOX4Q06945 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SOX4Q06945 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SOX4Q06945 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SOX4Q06945 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
SOX4Q06945 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
SOX4Q06945 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SOX4Q06945 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SOX4Q06945 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
SOX4Q06945 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SOX4Q06945 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SOX4Q06945 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SOX4Q06945 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SOX4Q06945 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SOX4Q06945 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SOX4Q06945 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SOX4Q06945 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SOX4Q06945 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms