Protein–RNA interactions for Protein: Q06455

RUNX1T1, Protein CBFA2T1, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX1T1Q06455 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
RUNX1T1Q06455 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RUNX1T1Q06455 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RUNX1T1Q06455 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RUNX1T1Q06455 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RUNX1T1Q06455 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
RUNX1T1Q06455 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RUNX1T1Q06455 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RUNX1T1Q06455 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RUNX1T1Q06455 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RUNX1T1Q06455 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RUNX1T1Q06455 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RUNX1T1Q06455 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RUNX1T1Q06455 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RUNX1T1Q06455 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RUNX1T1Q06455 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RUNX1T1Q06455 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
RUNX1T1Q06455 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RUNX1T1Q06455 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RUNX1T1Q06455 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RUNX1T1Q06455 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RUNX1T1Q06455 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RUNX1T1Q06455 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RUNX1T1Q06455 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RUNX1T1Q06455 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RUNX1T1Q06455 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RUNX1T1Q06455 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RUNX1T1Q06455 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RUNX1T1Q06455 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RUNX1T1Q06455 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RUNX1T1Q06455 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RUNX1T1Q06455 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RUNX1T1Q06455 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RUNX1T1Q06455 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RUNX1T1Q06455 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RUNX1T1Q06455 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RUNX1T1Q06455 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RUNX1T1Q06455 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RUNX1T1Q06455 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RUNX1T1Q06455 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RUNX1T1Q06455 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RUNX1T1Q06455 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RUNX1T1Q06455 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
RUNX1T1Q06455 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RUNX1T1Q06455 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RUNX1T1Q06455 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RUNX1T1Q06455 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RUNX1T1Q06455 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RUNX1T1Q06455 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RUNX1T1Q06455 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RUNX1T1Q06455 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RUNX1T1Q06455 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RUNX1T1Q06455 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RUNX1T1Q06455 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RUNX1T1Q06455 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RUNX1T1Q06455 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RUNX1T1Q06455 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RUNX1T1Q06455 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RUNX1T1Q06455 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RUNX1T1Q06455 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RUNX1T1Q06455 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RUNX1T1Q06455 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RUNX1T1Q06455 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RUNX1T1Q06455 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RUNX1T1Q06455 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
RUNX1T1Q06455 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RUNX1T1Q06455 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RUNX1T1Q06455 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RUNX1T1Q06455 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RUNX1T1Q06455 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RUNX1T1Q06455 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RUNX1T1Q06455 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RUNX1T1Q06455 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
RUNX1T1Q06455 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
RUNX1T1Q06455 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RUNX1T1Q06455 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RUNX1T1Q06455 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RUNX1T1Q06455 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RUNX1T1Q06455 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RUNX1T1Q06455 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RUNX1T1Q06455 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RUNX1T1Q06455 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RUNX1T1Q06455 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RUNX1T1Q06455 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RUNX1T1Q06455 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RUNX1T1Q06455 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RUNX1T1Q06455 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RUNX1T1Q06455 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RUNX1T1Q06455 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RUNX1T1Q06455 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RUNX1T1Q06455 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RUNX1T1Q06455 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RUNX1T1Q06455 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RUNX1T1Q06455 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RUNX1T1Q06455 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RUNX1T1Q06455 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RUNX1T1Q06455 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
RUNX1T1Q06455 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RUNX1T1Q06455 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RUNX1T1Q06455 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms