Protein–RNA interactions for Protein: Q05541

NSE3, Non-structural maintenance of chromosome element 3, yeastyeast

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Length 303 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
NSE3Q05541 YOL160WYOL160W 342 nt2.36□□□□□ -2.03
NSE3Q05541 YOR343W-BYOR343W-B 5313 nt2.36□□□□□ -2.03
NSE3Q05541 MDM20YOL076W 2391 nt2.36□□□□□ -2.03
NSE3Q05541 PDR8YLR266C 2106 nt2.35□□□□□ -2.03
NSE3Q05541 SPP41YDR464W 4308 nt2.35□□□□□ -2.03
NSE3Q05541 DGR2YKL121W 2559 nt2.34□□□□□ -2.03
NSE3Q05541 NEO1YIL048W 3456 nt2.34□□□□□ -2.03
NSE3Q05541 NIP100YPL174C 2607 nt2.34□□□□□ -2.04
NSE3Q05541 MGA2YIR033W 3342 nt2.33□□□□□ -2.04
NSE3Q05541 YMR242W-AYMR242W-A 90 nt2.33□□□□□ -2.04
NSE3Q05541 ZIP2YGL249W 2115 nt2.33□□□□□ -2.04
NSE3Q05541 ENV11YGR071C 2583 nt2.33□□□□□ -2.04
NSE3Q05541 APL2YKL135C 2181 nt2.32□□□□□ -2.04
NSE3Q05541 MSH6YDR097C 3729 nt2.32□□□□□ -2.04
NSE3Q05541 CSF1YLR087C 8877 nt2.32□□□□□ -2.04
NSE3Q05541 SRP14YDL092W 441 nt2.32□□□□□ -2.04
NSE3Q05541 SPT21YMR179W 2277 nt2.31□□□□□ -2.04
NSE3Q05541 MYO4YAL029C 4416 nt2.31□□□□□ -2.04
NSE3Q05541 YMR272W-BYMR272W-B 108 nt2.31□□□□□ -2.04
NSE3Q05541 YGL188C-AYGL188C-A 141 nt2.3□□□□□ -2.04
NSE3Q05541 YNL028WYNL028W 318 nt2.3□□□□□ -2.04
NSE3Q05541 HIR3YJR140C 4947 nt2.3□□□□□ -2.04
NSE3Q05541 PIG1YLR273C 1947 nt2.29□□□□□ -2.04
NSE3Q05541 SSS1YDR086C 243 nt2.29□□□□□ -2.04
NSE3Q05541 YEL020C-BYEL020C-B 198 nt2.29□□□□□ -2.04
NSE3Q05541 TMA7YLR262C-A 195 nt2.29□□□□□ -2.04
NSE3Q05541 snR49snR49 165 nt2.28□□□□□ -2.04
NSE3Q05541 SPC98YNL126W 2541 nt2.27□□□□□ -2.05
NSE3Q05541 CSE2YNR010W 450 nt2.27□□□□□ -2.05
NSE3Q05541 VIK1YPL253C 1944 nt2.27□□□□□ -2.05
NSE3Q05541 MAD1YGL086W 2250 nt2.26□□□□□ -2.05
NSE3Q05541 ANS1YHR126C 480 nt2.26□□□□□ -2.05
NSE3Q05541 RAD34YDR314C 2079 nt2.26□□□□□ -2.05
NSE3Q05541 UBP2YOR124C 3819 nt2.25□□□□□ -2.05
NSE3Q05541 SFB2YNL049C 2631 nt2.25□□□□□ -2.05
NSE3Q05541 UTP21YLR409C 2820 nt2.24□□□□□ -2.05
NSE3Q05541 YDR182W-AYDR182W-A 204 nt2.24□□□□□ -2.05
NSE3Q05541 YIR044CYIR044C 186 nt2.24□□□□□ -2.05
NSE3Q05541 MCD1YDL003W 1701 nt2.24□□□□□ -2.05
NSE3Q05541 USO1YDL058W 5373 nt2.24□□□□□ -2.05
NSE3Q05541 YHR214C-BYHR214C-B 5382 nt2.24□□□□□ -2.05
NSE3Q05541 YCK3YER123W 1575 nt2.23□□□□□ -2.05
NSE3Q05541 ELG1YOR144C 2376 nt2.23□□□□□ -2.05
NSE3Q05541 YJR039WYJR039W 3366 nt2.23□□□□□ -2.05
NSE3Q05541 YNL144CYNL144C 2223 nt2.23□□□□□ -2.05
NSE3Q05541 MPT5YGL178W 2580 nt2.23□□□□□ -2.05
NSE3Q05541 PAU3YCR104W 375 nt2.22□□□□□ -2.05
NSE3Q05541 PAU2YEL049W 363 nt2.21□□□□□ -2.06
NSE3Q05541 RPL34BYIL052C 366 nt2.21□□□□□ -2.06
NSE3Q05541 HSL1YKL101W 4557 nt2.2□□□□□ -2.06
NSE3Q05541 AI5_ALPHAQ0070 1893 nt2.2□□□□□ -2.06
NSE3Q05541 YOL155W-AYOL155W-A 135 nt2.2□□□□□ -2.06
NSE3Q05541 YBR064WYBR064W 429 nt2.2□□□□□ -2.06
NSE3Q05541 TRM3YDL112W 4311 nt2.19□□□□□ -2.06
NSE3Q05541 INA22YIR024C 651 nt2.19□□□□□ -2.06
NSE3Q05541 YMR321CYMR321C 318 nt2.19□□□□□ -2.06
NSE3Q05541 LHS1YKL073W 2646 nt2.19□□□□□ -2.06
NSE3Q05541 CUL3YGR003W 2235 nt2.18□□□□□ -2.06
NSE3Q05541 SPG3YDR504C 384 nt2.18□□□□□ -2.06
NSE3Q05541 YJL197C-AYJL197C-A 282 nt2.18□□□□□ -2.06
NSE3Q05541 YLR120W-AYLR120W-A 102 nt2.18□□□□□ -2.06
NSE3Q05541 YMR172C-AYMR172C-A 384 nt2.18□□□□□ -2.06
NSE3Q05541 CFT1YDR301W 4074 nt2.17□□□□□ -2.06
NSE3Q05541 snR55snR55 98 nt2.17□□□□□ -2.06
NSE3Q05541 YMR175W-AYMR175W-A 195 nt2.17□□□□□ -2.06
NSE3Q05541 YOR218CYOR218C 420 nt2.17□□□□□ -2.06
NSE3Q05541 PDE2YOR360C 1581 nt2.17□□□□□ -2.06
NSE3Q05541 NOC3YLR002C 1992 nt2.17□□□□□ -2.06
NSE3Q05541 IRC20YLR247C 4671 nt2.17□□□□□ -2.06
NSE3Q05541 YGL052WYGL052W 306 nt2.16□□□□□ -2.06
NSE3Q05541 VPS54YDR027C 2670 nt2.16□□□□□ -2.06
NSE3Q05541 PTP2YOR208W 2253 nt2.16□□□□□ -2.06
NSE3Q05541 NUP192YJL039C 5052 nt2.15□□□□□ -2.06
NSE3Q05541 RPS27BYHR021C 249 nt2.15□□□□□ -2.07
NSE3Q05541 EMC5YIL027C 426 nt2.15□□□□□ -2.07
NSE3Q05541 ABF2YMR072W 552 nt2.15□□□□□ -2.07
NSE3Q05541 IES4YOR189W 351 nt2.14□□□□□ -2.07
NSE3Q05541 ADR1YDR216W 3972 nt2.14□□□□□ -2.07
NSE3Q05541 YOR093CYOR093C 4947 nt2.14□□□□□ -2.07
NSE3Q05541 SPO75YLL005C 2607 nt2.14□□□□□ -2.07
NSE3Q05541 SLI15YBR156C 2097 nt2.13□□□□□ -2.07
NSE3Q05541 SKI3YPR189W 4299 nt2.12□□□□□ -2.07
NSE3Q05541 TBS1YBR150C 3285 nt2.12□□□□□ -2.07
NSE3Q05541 CDC36YDL165W 576 nt2.12□□□□□ -2.07
NSE3Q05541 RPS25BYLR333C 327 nt2.12□□□□□ -2.07
NSE3Q05541 YMR307C-AYMR307C-A 195 nt2.12□□□□□ -2.07
NSE3Q05541 SPO24YPR036W-A 204 nt2.12□□□□□ -2.07
NSE3Q05541 MYO2YOR326W 4725 nt2.12□□□□□ -2.07
NSE3Q05541 UBR2YLR024C 5619 nt2.12□□□□□ -2.07
NSE3Q05541 YLR035C-AYLR035C-A 3468 nt2.11□□□□□ -2.07
NSE3Q05541 snR80snR80 171 nt2.11□□□□□ -2.07
NSE3Q05541 tM(CAU)Q1tM(CAU)Q1 76 nt2.11□□□□□ -2.07
NSE3Q05541 YOR015WYOR015W 360 nt2.11□□□□□ -2.07
NSE3Q05541 YLL007CYLL007C 1998 nt2.1□□□□□ -2.07
NSE3Q05541 YMR230W-AYMR230W-A 189 nt2.1□□□□□ -2.07
NSE3Q05541 YMR045CYMR045C 5268 nt2.09□□□□□ -2.07
NSE3Q05541 NUT1YGL151W 3399 nt2.09□□□□□ -2.07
NSE3Q05541 YJL120WYJL120W 324 nt2.09□□□□□ -2.07
NSE3Q05541 SEC5YDR166C 2916 nt2.08□□□□□ -2.08
NSE3Q05541 RTP1YMR185W 2946 nt2.08□□□□□ -2.08
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