Protein–RNA interactions for Protein: Q04844

CHRNE, Acetylcholine receptor subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNEQ04844 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CHRNEQ04844 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CHRNEQ04844 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CHRNEQ04844 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CHRNEQ04844 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CHRNEQ04844 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CHRNEQ04844 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CHRNEQ04844 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CHRNEQ04844 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CHRNEQ04844 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CHRNEQ04844 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
CHRNEQ04844 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
CHRNEQ04844 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CHRNEQ04844 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CHRNEQ04844 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CHRNEQ04844 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CHRNEQ04844 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CHRNEQ04844 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
CHRNEQ04844 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CHRNEQ04844 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CHRNEQ04844 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CHRNEQ04844 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CHRNEQ04844 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CHRNEQ04844 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CHRNEQ04844 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CHRNEQ04844 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CHRNEQ04844 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CHRNEQ04844 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CHRNEQ04844 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CHRNEQ04844 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CHRNEQ04844 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CHRNEQ04844 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CHRNEQ04844 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CHRNEQ04844 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CHRNEQ04844 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CHRNEQ04844 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CHRNEQ04844 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CHRNEQ04844 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CHRNEQ04844 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CHRNEQ04844 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CHRNEQ04844 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CHRNEQ04844 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CHRNEQ04844 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CHRNEQ04844 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CHRNEQ04844 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CHRNEQ04844 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CHRNEQ04844 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
CHRNEQ04844 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CHRNEQ04844 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CHRNEQ04844 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CHRNEQ04844 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CHRNEQ04844 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
CHRNEQ04844 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CHRNEQ04844 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CHRNEQ04844 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
CHRNEQ04844 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CHRNEQ04844 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
CHRNEQ04844 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CHRNEQ04844 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CHRNEQ04844 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CHRNEQ04844 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CHRNEQ04844 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CHRNEQ04844 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CHRNEQ04844 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CHRNEQ04844 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CHRNEQ04844 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CHRNEQ04844 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CHRNEQ04844 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CHRNEQ04844 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CHRNEQ04844 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CHRNEQ04844 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CHRNEQ04844 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CHRNEQ04844 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CHRNEQ04844 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CHRNEQ04844 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CHRNEQ04844 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CHRNEQ04844 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CHRNEQ04844 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CHRNEQ04844 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CHRNEQ04844 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CHRNEQ04844 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CHRNEQ04844 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CHRNEQ04844 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CHRNEQ04844 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CHRNEQ04844 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CHRNEQ04844 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CHRNEQ04844 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CHRNEQ04844 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CHRNEQ04844 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CHRNEQ04844 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CHRNEQ04844 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CHRNEQ04844 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CHRNEQ04844 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CHRNEQ04844 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CHRNEQ04844 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CHRNEQ04844 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CHRNEQ04844 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CHRNEQ04844 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
CHRNEQ04844 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CHRNEQ04844 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms